More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0369 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0369  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 436 aa  892    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3207  FAD dependent oxidoreductase  55.87 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0816  FAD dependent oxidoreductase  55.4 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210853 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3055  FAD dependent oxidoreductase  55.79 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3310  FAD dependent oxidoreductase  54.79 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0978  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase, family protein  54.79 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3425  FAD dependent oxidoreductase  54.69 
 
 		 391 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3620  FAD dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3497  FAD dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0867  FAD dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0752  FAD dependent oxidoreductase  54.48 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0836  FAD dependent oxidoreductase  51.23 
 
 		 391 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0800  FAD dependent oxidoreductase  51.35 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0935  FAD dependent oxidoreductase  53.3 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0629  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.25 
 
 		 404 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2531  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 391 aa  279  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58896  normal  0.0803699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1482  Fis family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.775538  normal  0.852697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 550 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 543 aa  196  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 556 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 		 507 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.98 
 
 		 507 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 522 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.26 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.26 
 
 		 502 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 528 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.85 
 
 		 495 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.61 
 
 		 557 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.74 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 545 aa  173  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.01 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.26 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2385  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.55 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.54 
 
 		 526 aa  170  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 566 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.17 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.16 
 
 		 503 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.17 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.93 
 
 		 517 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.09 
 
 		 510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.74 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.28 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.35 
 
 		 547 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.7 
 
 		 512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4734  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.04 
 
 		 501 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.04 
 
 		 501 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.389691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03277  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)-binding  32.04 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0288  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03229  hypothetical protein  32.04 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3623  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.04 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.04 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3902  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.04 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.16 
 
 		 506 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0094  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.53 
 
 		 516 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.05 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1114  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.52 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.4 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4129  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.05 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.5 
 
 		 512 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 539 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.2 
 
 		 516 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 510 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1073  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.27 
 
 		 514 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.81 
 
 		 504 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.41 
 
 		 509 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.17 
 
 		 511 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3348  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.45 
 
 		 509 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.16 
 
 		 506 aa  159  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 536 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.38 
 
 		 511 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.16 
 
 		 514 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.53 
 
 		 509 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.16 
 
 		 503 aa  159  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3045  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.5 
 
 		 525 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.399591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 548 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 546 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 567 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2066  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.32 
 
 		 507 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2677  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.32 
 
 		 507 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0420  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.82 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.03 
 
 		 508 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.55 
 
 		 507 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.92 
 
 		 525 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0082196  normal  0.374558 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.36 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 552 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4534  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.85 
 
 		 512 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443601  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.53 
 
 		 491 aa  156  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.14 
 
 		 509 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.46 
 
 		 504 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.57 
 
 		 503 aa  156  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.17 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.59 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0639  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.39 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1827  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.17 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.17112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>