More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0935 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0935  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 391 aa  802    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0836  FAD dependent oxidoreductase  71.51 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3425  FAD dependent oxidoreductase  65.64 
 
 		 391 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3620  FAD dependent oxidoreductase  65.13 
 
 		 391 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3497  FAD dependent oxidoreductase  65.64 
 
 		 391 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0867  FAD dependent oxidoreductase  65.64 
 
 		 391 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0816  FAD dependent oxidoreductase  65.32 
 
 		 396 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3207  FAD dependent oxidoreductase  65.32 
 
 		 396 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3310  FAD dependent oxidoreductase  64.78 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3055  FAD dependent oxidoreductase  65.64 
 
 		 391 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0752  FAD dependent oxidoreductase  64.84 
 
 		 391 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0978  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase, family protein  62.82 
 
 		 391 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0800  FAD dependent oxidoreductase  61.02 
 
 		 413 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0629  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.21 
 
 		 404 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0369  FAD dependent oxidoreductase  53.3 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2531  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58896  normal  0.0803699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1482  Fis family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 398 aa  262  8.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.775538  normal  0.852697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 556 aa  206  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 550 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 		 356 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 		 528 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 522 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 532 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 532 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 533 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.6 
 
 		 495 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.04 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.3 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 545 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.55 
 
 		 557 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.04 
 
 		 502 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.59 
 
 		 526 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2442  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.5 
 
 		 502 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.45 
 
 		 507 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 529 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.45 
 
 		 507 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.1 
 
 		 489 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1827  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.08 
 
 		 513 aa  172  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.17112  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.05 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.63 
 
 		 514 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.51 
 
 		 491 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 566 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.39 
 
 		 511 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1143  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.77 
 
 		 500 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 		 539 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 567 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 548 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.38 
 
 		 530 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 536 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.87 
 
 		 525 aa  164  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.2 
 
 		 503 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.59 
 
 		 551 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.85 
 
 		 516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2066  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 507 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2677  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 507 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 540 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 543 aa  162  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 536 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.99 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 507 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.93 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.76 
 
 		 507 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.89 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 		 503 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.77 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1114  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.95 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.92 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.09 
 
 		 510 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 537 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1073  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.6 
 
 		 514 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.95 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.62 
 
 		 547 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 526 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.54 
 
 		 507 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.27 
 
 		 526 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 574 aa  159  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.02 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0082196  normal  0.374558 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.71 
 
 		 514 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.29 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  29.97 
 
 		 543 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0740  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.14 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 537 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0241  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570878  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2980  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.02 
 
 		 525 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.68 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3524  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.08 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2453  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0726  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125098  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 555 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2372  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2705  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.64 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  31.84 
 
 		 545 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>