More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0836 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0836  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 391 aa  801    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0935  FAD dependent oxidoreductase  71.61 
 
 		 391 aa  547  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0867  FAD dependent oxidoreductase  65.32 
 
 		 391 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3497  FAD dependent oxidoreductase  65.05 
 
 		 391 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3425  FAD dependent oxidoreductase  64.52 
 
 		 391 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3620  FAD dependent oxidoreductase  63.98 
 
 		 391 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3207  FAD dependent oxidoreductase  65.05 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0816  FAD dependent oxidoreductase  64.25 
 
 		 396 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210853 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3310  FAD dependent oxidoreductase  64.25 
 
 		 396 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3055  FAD dependent oxidoreductase  64.78 
 
 		 391 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0978  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase, family protein  62.63 
 
 		 391 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0752  FAD dependent oxidoreductase  64.1 
 
 		 391 aa  478  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0800  FAD dependent oxidoreductase  59.49 
 
 		 413 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0629  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.97 
 
 		 404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0369  FAD dependent oxidoreductase  51.78 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2531  FAD dependent oxidoreductase  43.05 
 
 		 391 aa  296  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58896  normal  0.0803699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1482  Fis family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.775538  normal  0.852697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 		 550 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 543 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 556 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 356 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 		 545 aa  189  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 522 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 528 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.81 
 
 		 557 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.6 
 
 		 502 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.15 
 
 		 502 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.8 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.21 
 
 		 489 aa  170  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 533 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2442  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.68 
 
 		 502 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1143  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.53 
 
 		 500 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.24 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.16 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.75 
 
 		 511 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 567 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.51 
 
 		 514 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.77 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  32.46 
 
 		 543 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 552 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.6 
 
 		 507 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 532 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 532 aa  166  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.07 
 
 		 551 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 574 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 546 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 529 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.62 
 
 		 500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.6 
 
 		 516 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 536 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 507 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 566 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2066  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.43 
 
 		 507 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2677  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.43 
 
 		 507 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.43 
 
 		 507 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.17 
 
 		 510 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 548 aa  160  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.15 
 
 		 507 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 536 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 527 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.69 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.68 
 
 		 530 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 519 aa  156  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.11 
 
 		 517 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.43 
 
 		 512 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 539 aa  155  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.16 
 
 		 547 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.16 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.51 
 
 		 507 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1073  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.77 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1827  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.51 
 
 		 513 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.17112  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.13 
 
 		 605 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3524  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.04 
 
 		 493 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.9 
 
 		 502 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.68 
 
 		 500 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 547 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 518 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.74 
 
 		 506 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.87 
 
 		 513 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1114  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.77 
 
 		 512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  29.41 
 
 		 545 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.33 
 
 		 526 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 555 aa  152  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.15 
 
 		 513 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.24 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 543 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.17 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.99 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.74 
 
 		 506 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 519 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.19 
 
 		 503 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 520 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.79 
 
 		 511 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.6 
 
 		 512 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2206  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.02 
 
 		 526 aa  150  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.440136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.61 
 
 		 509 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.49 
 
 		 509 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>