More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3207 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3055  FAD dependent oxidoreductase  81.33 
 
 		 391 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0978  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase, family protein  90.28 
 
 		 391 aa  703    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0867  FAD dependent oxidoreductase  82.61 
 
 		 391 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3497  FAD dependent oxidoreductase  82.61 
 
 		 391 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3425  FAD dependent oxidoreductase  83.12 
 
 		 391 aa  660    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0816  FAD dependent oxidoreductase  97.22 
 
 		 396 aa  763    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3207  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 396 aa  812    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3310  FAD dependent oxidoreductase  95.45 
 
 		 396 aa  750    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3620  FAD dependent oxidoreductase  82.61 
 
 		 391 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0836  FAD dependent oxidoreductase  64.96 
 
 		 391 aa  498  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0752  FAD dependent oxidoreductase  62.91 
 
 		 391 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0935  FAD dependent oxidoreductase  65.13 
 
 		 391 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0629  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  61.29 
 
 		 404 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0800  FAD dependent oxidoreductase  58.18 
 
 		 413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0369  FAD dependent oxidoreductase  55.87 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2531  FAD dependent oxidoreductase  42.3 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58896  normal  0.0803699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1482  Fis family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.775538  normal  0.852697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 550 aa  209  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 		 545 aa  199  7.999999999999999e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  36.79 
 
 		 556 aa  195  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 522 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  35.37 
 
 		 543 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.9 
 
 		 557 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.13 
 
 		 500 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 495 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 536 aa  183  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 528 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.64 
 
 		 489 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 566 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 533 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.36 
 
 		 514 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 		 537 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.19 
 
 		 526 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.76 
 
 		 530 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.04 
 
 		 516 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1073  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.27 
 
 		 514 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.2 
 
 		 510 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 537 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.27 
 
 		 509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1114  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.13 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.73 
 
 		 508 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 529 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.16 
 
 		 503 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 536 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.42 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 548 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 567 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.79 
 
 		 512 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.58 
 
 		 509 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.95 
 
 		 511 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.97 
 
 		 512 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 526 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 		 502 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 539 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4534  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.1 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443601  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.78 
 
 		 502 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.55 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.27 
 
 		 512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.95 
 
 		 504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.55 
 
 		 512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 532 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.36 
 
 		 502 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.51 
 
 		 502 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.75 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.27 
 
 		 511 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3524  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.07 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.62 
 
 		 513 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 555 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.23 
 
 		 499 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.27 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2066  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.79 
 
 		 507 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.16 
 
 		 503 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2677  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.79 
 
 		 507 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.52 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 546 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.79 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2385  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.25 
 
 		 513 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.79 
 
 		 507 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.41 
 
 		 525 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3348  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.85 
 
 		 509 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.25 
 
 		 509 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.48 
 
 		 506 aa  163  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.96 
 
 		 496 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.51 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 520 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 524 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.4 
 
 		 507 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.4 
 
 		 514 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.82 
 
 		 510 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.52 
 
 		 507 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.4 
 
 		 507 aa  159  6e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2442  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.75 
 
 		 502 aa  159  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 546 aa  159  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.72 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0082196  normal  0.374558 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2206  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.93 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.440136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>