More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2531 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2531  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
391 aa  790    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58896  normal  0.0803699 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0800  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 
413 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0369  FAD dependent oxidoreductase  40.09 
 
 
436 aa  279  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0816  FAD dependent oxidoreductase  43.05 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3207  FAD dependent oxidoreductase  42.3 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3310  FAD dependent oxidoreductase  43.47 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0836  FAD dependent oxidoreductase  40.59 
 
 
391 aa  272  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3497  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 
391 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3620  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 
391 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3425  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 
391 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0867  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 
391 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3055  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 
391 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1482  Fis family transcriptional regulator  42.08 
 
 
398 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.775538  normal  0.852697 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0752  FAD dependent oxidoreductase  42.5 
 
 
391 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0978  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase, family protein  40.72 
 
 
391 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0629  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.78 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0935  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 
391 aa  245  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
550 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
543 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.73 
 
 
496 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.92 
 
 
526 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1143  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.26 
 
 
500 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 
556 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.65 
 
 
516 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
495 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 
545 aa  189  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.86 
 
 
502 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.95 
 
 
502 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3524  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.66 
 
 
493 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472556  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.2 
 
 
500 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.16 
 
 
510 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.32 
 
 
509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.69 
 
 
502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.56 
 
 
489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2385  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.55 
 
 
513 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.9 
 
 
557 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.51 
 
 
512 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.12 
 
 
513 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.33 
 
 
491 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 
567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 
543 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.89 
 
 
514 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.2 
 
 
512 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.52 
 
 
517 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 
522 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.2 
 
 
547 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.05 
 
 
513 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 
566 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 
519 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3531  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.77 
 
 
534 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.959942  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 
529 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3348  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.28 
 
 
509 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 
546 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.03 
 
 
526 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 
506 aa  172  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 
506 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.46 
 
 
503 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 
536 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2574  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37 
 
 
495 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 
516 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 
552 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2442  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.51 
 
 
502 aa  170  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 
574 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1361  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.37 
 
 
516 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.62 
 
 
514 aa  169  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.04 
 
 
510 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.6 
 
 
509 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.37 
 
 
512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.64 
 
 
512 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
600 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.81 
 
 
511 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1827  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.6 
 
 
513 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.17112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.38 
 
 
511 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
528 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 
519 aa  166  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5324  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.26 
 
 
503 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575956  normal  0.50041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.98 
 
 
510 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4534  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.56 
 
 
512 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443601  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.35 
 
 
503 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1559  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 
523 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0740  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.9 
 
 
510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0241  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.9 
 
 
510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.9 
 
 
510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.69 
 
 
510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.83 
 
 
507 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.54 
 
 
509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.24 
 
 
525 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0082196  normal  0.374558 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.34 
 
 
507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0726  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.9 
 
 
510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2453  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.9 
 
 
510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2705  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.9 
 
 
510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2372  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.9 
 
 
510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1240  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.41 
 
 
515 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.07 
 
 
507 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2980  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.51 
 
 
525 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  30.24 
 
 
543 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1090  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.47 
 
 
514 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
509 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
527 aa  163  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>