More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0752 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0752  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 391 aa  803    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3055  FAD dependent oxidoreductase  65.64 
 
 		 391 aa  511  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3620  FAD dependent oxidoreductase  63.85 
 
 		 391 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3425  FAD dependent oxidoreductase  64.36 
 
 		 391 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3497  FAD dependent oxidoreductase  64.1 
 
 		 391 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3310  FAD dependent oxidoreductase  64.25 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0816  FAD dependent oxidoreductase  63.44 
 
 		 396 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3207  FAD dependent oxidoreductase  63.44 
 
 		 396 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0978  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase, family protein  63.44 
 
 		 391 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0867  FAD dependent oxidoreductase  63.33 
 
 		 391 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0836  FAD dependent oxidoreductase  64.1 
 
 		 391 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0935  FAD dependent oxidoreductase  65.64 
 
 		 391 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0629  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.72 
 
 		 404 aa  455  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0800  FAD dependent oxidoreductase  59.23 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0369  FAD dependent oxidoreductase  54.93 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2531  FAD dependent oxidoreductase  43.98 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58896  normal  0.0803699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1482  Fis family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.775538  normal  0.852697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 		 550 aa  212  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 543 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 556 aa  202  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.79 
 
 		 557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  35.6 
 
 		 522 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.46 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 		 545 aa  192  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.31 
 
 		 495 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.39 
 
 		 514 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.56 
 
 		 496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 567 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1143  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.3 
 
 		 500 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.32 
 
 		 502 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.6 
 
 		 511 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.08 
 
 		 489 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 		 516 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.05 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.78 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.84 
 
 		 507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1827  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.39 
 
 		 513 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.17112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.93 
 
 		 510 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.84 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.11 
 
 		 503 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1114  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.84 
 
 		 512 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.38 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.83 
 
 		 513 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 552 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1073  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.84 
 
 		 514 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.38 
 
 		 508 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.1 
 
 		 509 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.6 
 
 		 512 aa  176  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.48 
 
 		 500 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 528 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.99 
 
 		 506 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.42 
 
 		 513 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 546 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 516 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.51 
 
 		 510 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 		 519 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3524  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.66 
 
 		 493 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.6 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 536 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.43 
 
 		 506 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.6 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 		 536 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 532 aa  170  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 532 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.73 
 
 		 530 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 539 aa  169  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3348  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.97 
 
 		 509 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 533 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 548 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.22 
 
 		 510 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.2 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.38 
 
 		 504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 529 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.16 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.63 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.6 
 
 		 551 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.2 
 
 		 504 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 566 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2106  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.92 
 
 		 501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2980  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.49 
 
 		 525 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  34.63 
 
 		 526 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 		 525 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0082196  normal  0.374558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.17 
 
 		 531 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.7 
 
 		 502 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  34.49 
 
 		 517 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 519 aa  163  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.45 
 
 		 517 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4534  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.63 
 
 		 512 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443601  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.05 
 
 		 499 aa  162  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.52 
 
 		 509 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3684  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.09 
 
 		 515 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2385  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.99 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.59 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.15 
 
 		 507 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.44 
 
 		 510 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>