More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1498 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1498  ammonium transporter family protein  100 
 
 		 416 aa  822    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.943229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2080  ammonium transporter  72.6 
 
 		 416 aa  586  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.157112  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2116  ammonium transporter  72.6 
 
 		 416 aa  586  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  47.98 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  47.8 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  47.07 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  47.07 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  47.32 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  47.32 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  47.32 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  47.07 
 
 		 410 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  46.83 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  46.83 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  47.42 
 
 		 434 aa  368  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  43.1 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  47.04 
 
 		 461 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  43.95 
 
 		 405 aa  346  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  44.25 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  46.31 
 
 		 462 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  43.35 
 
 		 451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  43.8 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  43.8 
 
 		 500 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  43.8 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  43.8 
 
 		 478 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  43.8 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  43.8 
 
 		 500 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  43.8 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  44.91 
 
 		 464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  43.21 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  43.07 
 
 		 469 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  42.34 
 
 		 500 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  42.34 
 
 		 500 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  42.34 
 
 		 500 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  42.34 
 
 		 500 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  42.34 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  41.98 
 
 		 438 aa  319  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  41.98 
 
 		 438 aa  319  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  41.13 
 
 		 472 aa  319  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  44.58 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  44.33 
 
 		 405 aa  316  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  42.65 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  40.29 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  40.88 
 
 		 501 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  41.03 
 
 		 427 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  41.67 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  42.51 
 
 		 411 aa  310  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  40.25 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  41.15 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0776  ammonia permease  42.71 
 
 		 398 aa  309  5e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  42.26 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  42.65 
 
 		 413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1679  ammonia permease  40.99 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  39.6 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  39.9 
 
 		 499 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  43.32 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  43.07 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  39.16 
 
 		 434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  39.42 
 
 		 502 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  42.82 
 
 		 437 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  43.07 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  41.32 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  40.15 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  43.9 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  40.05 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  40.25 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  40.67 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  43.49 
 
 		 433 aa  300  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  41.91 
 
 		 408 aa  299  7e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  39.22 
 
 		 454 aa  298  9e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  42.26 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  41.63 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  43.14 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  42.26 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  44.47 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  39.76 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  42.61 
 
 		 466 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  42.09 
 
 		 497 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  42.09 
 
 		 503 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  38.12 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  39.29 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  42.61 
 
 		 466 aa  296  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  40.45 
 
 		 504 aa  296  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  38.11 
 
 		 432 aa  296  6e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  42.12 
 
 		 466 aa  295  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  38.31 
 
 		 443 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  40.93 
 
 		 455 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  43 
 
 		 446 aa  292  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  39.95 
 
 		 405 aa  292  7e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  40.78 
 
 		 431 aa  292  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  39.12 
 
 		 494 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  43.07 
 
 		 411 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  41.19 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  41.4 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  41.4 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  40.71 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  41.58 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  41.4 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  39.61 
 
 		 428 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  40.47 
 
 		 515 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  38.41 
 
 		 515 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>