More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0776 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0776  ammonia permease  100 
 
 		 398 aa  767    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  50 
 
 		 413 aa  356  3.9999999999999996e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  48.01 
 
 		 411 aa  351  2e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  48.38 
 
 		 457 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  48.74 
 
 		 428 aa  343  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  47.79 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  48.62 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  47 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  47.5 
 
 		 431 aa  335  9e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  47.62 
 
 		 410 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  47.37 
 
 		 411 aa  329  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  49.13 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  45.16 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  44.91 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  45.98 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  45.98 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  47.74 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  47.37 
 
 		 410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  48.38 
 
 		 451 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  47.37 
 
 		 410 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  47.12 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  47.12 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  47.12 
 
 		 410 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  45.39 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  47.12 
 
 		 410 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  46.87 
 
 		 410 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  45.15 
 
 		 466 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  45.15 
 
 		 500 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  45.15 
 
 		 466 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  45.15 
 
 		 500 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  45.15 
 
 		 466 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  45.15 
 
 		 444 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  45.15 
 
 		 478 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  45.95 
 
 		 436 aa  322  9.000000000000001e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  46.52 
 
 		 463 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  47.88 
 
 		 405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  47.12 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  44.75 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  46.23 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  47.63 
 
 		 467 aa  316  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  44.17 
 
 		 501 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  45.15 
 
 		 499 aa  316  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  46.85 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1679  ammonia permease  43.73 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  46.23 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  43.11 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  43.69 
 
 		 504 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  45.39 
 
 		 502 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  47.63 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  43.93 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  43.93 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  43.93 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  46.14 
 
 		 472 aa  309  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  43.07 
 
 		 431 aa  308  9e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  43.2 
 
 		 500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  44.15 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  44.94 
 
 		 452 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  41.94 
 
 		 445 aa  305  8.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  44.21 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  42.33 
 
 		 494 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  45 
 
 		 459 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  44.61 
 
 		 466 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  42.23 
 
 		 513 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  45.36 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  44.11 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  43.14 
 
 		 449 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  44.29 
 
 		 515 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  49.63 
 
 		 470 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  45.02 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  44.05 
 
 		 515 aa  299  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  41.31 
 
 		 405 aa  298  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  47.36 
 
 		 423 aa  298  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  42 
 
 		 510 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04231  hypothetical protein  43.87 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  40.8 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  48 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  46.23 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  45.68 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  47.03 
 
 		 405 aa  298  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  43.29 
 
 		 476 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  43.94 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  43.06 
 
 		 477 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  46.02 
 
 		 408 aa  295  7e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  40.56 
 
 		 506 aa  295  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1498  ammonium transporter family protein  42.71 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.943229  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  43.45 
 
 		 497 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  43.45 
 
 		 503 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  42.13 
 
 		 515 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  45.77 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  47.26 
 
 		 455 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  40.49 
 
 		 500 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  45.89 
 
 		 408 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  42.13 
 
 		 524 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  43.33 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  45.75 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  39.25 
 
 		 499 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  41.73 
 
 		 466 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  43.32 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  44.67 
 
 		 431 aa  290  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  41.73 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>