More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2116 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2080  ammonium transporter  100 
 
 
416 aa  827    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.157112  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2116  ammonium transporter  100 
 
 
416 aa  827    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1498  ammonium transporter family protein  72.6 
 
 
416 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.943229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  47.32 
 
 
410 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  46.78 
 
 
411 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  46.83 
 
 
410 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  46.83 
 
 
410 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  46.83 
 
 
410 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  47.07 
 
 
410 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  46.86 
 
 
410 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  47.07 
 
 
410 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  46.59 
 
 
410 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  46.06 
 
 
457 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  43.87 
 
 
467 aa  354  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  44.96 
 
 
434 aa  349  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  43.49 
 
 
449 aa  339  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  45.1 
 
 
461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  41.98 
 
 
405 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  44.09 
 
 
451 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  43.38 
 
 
462 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  42.96 
 
 
500 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  42.96 
 
 
466 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  42.96 
 
 
466 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  42.96 
 
 
466 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  42.96 
 
 
500 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  41.08 
 
 
472 aa  322  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  42.96 
 
 
444 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  42.96 
 
 
478 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  43.2 
 
 
469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  41.98 
 
 
438 aa  319  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  41.98 
 
 
438 aa  319  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  42.13 
 
 
429 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  44.47 
 
 
432 aa  316  5e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  40.64 
 
 
406 aa  315  8e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  42.12 
 
 
453 aa  315  9e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  41.99 
 
 
500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  41.99 
 
 
500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  41.99 
 
 
500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  41.99 
 
 
500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  41.63 
 
 
444 aa  312  5.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  41.5 
 
 
504 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  41.81 
 
 
501 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  42.15 
 
 
515 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  41.95 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  41.91 
 
 
470 aa  308  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  41.45 
 
 
515 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  40 
 
 
427 aa  306  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  40.98 
 
 
488 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  42.22 
 
 
411 aa  306  6e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  42.4 
 
 
413 aa  305  8.000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  39.71 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  38.77 
 
 
434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  41.91 
 
 
438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  41.48 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  40.42 
 
 
489 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  41.95 
 
 
431 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  39.41 
 
 
433 aa  302  8.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  43.47 
 
 
397 aa  301  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  44.44 
 
 
437 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  44.2 
 
 
437 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0776  ammonia permease  41.65 
 
 
398 aa  300  3e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  40.24 
 
 
431 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  44.2 
 
 
437 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  43.95 
 
 
437 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  40.78 
 
 
499 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  40.59 
 
 
405 aa  299  7e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  41.02 
 
 
502 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  41.87 
 
 
408 aa  298  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  40.94 
 
 
464 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  41.63 
 
 
408 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  38.86 
 
 
431 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  41.77 
 
 
432 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  40.79 
 
 
402 aa  297  3e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  38.56 
 
 
443 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  43.56 
 
 
423 aa  295  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  38.46 
 
 
435 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  37.94 
 
 
436 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  42.36 
 
 
433 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  43 
 
 
466 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  38.97 
 
 
429 aa  294  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  43 
 
 
466 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  39.47 
 
 
459 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  40.89 
 
 
408 aa  292  9e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  42.86 
 
 
401 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  40.65 
 
 
485 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  40.98 
 
 
445 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  41.99 
 
 
503 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  39.01 
 
 
454 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  37.56 
 
 
439 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  41.99 
 
 
497 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  42.47 
 
 
466 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  40.2 
 
 
402 aa  288  9e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  42.82 
 
 
411 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  40.49 
 
 
453 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  39.76 
 
 
439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  41.63 
 
 
446 aa  285  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  38.89 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  42.75 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2232  ammonium transporter  40 
 
 
394 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  42.08 
 
 
457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>