100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0604 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 
480 aa  931    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.81 
 
 
535 aa  194  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.56 
 
 
530 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.91 
 
 
508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.46 
 
 
533 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.17 
 
 
519 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.27 
 
 
508 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.7 
 
 
535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.91 
 
 
544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.27 
 
 
525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.9 
 
 
507 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.27 
 
 
525 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.81 
 
 
525 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.24 
 
 
508 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31 
 
 
532 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.44 
 
 
508 aa  176  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.05 
 
 
531 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.39 
 
 
526 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.24 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.19 
 
 
535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.05 
 
 
508 aa  174  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.04 
 
 
532 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.2 
 
 
517 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.86 
 
 
531 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.11 
 
 
540 aa  170  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.54 
 
 
568 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.86 
 
 
508 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.86 
 
 
508 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.8 
 
 
531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.22 
 
 
563 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.54 
 
 
540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.05 
 
 
523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.19 
 
 
524 aa  162  9e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.36 
 
 
522 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.84 
 
 
525 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.26 
 
 
536 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.05 
 
 
523 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.39 
 
 
535 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.01 
 
 
506 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.91 
 
 
534 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.91 
 
 
534 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.42 
 
 
526 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.4 
 
 
546 aa  153  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.95 
 
 
541 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.04 
 
 
541 aa  150  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.53 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.7 
 
 
530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  26.18 
 
 
493 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  29.86 
 
 
487 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  27.45 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  24.72 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  27.56 
 
 
482 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  27.38 
 
 
483 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  26.78 
 
 
480 aa  63.9  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  28.62 
 
 
488 aa  63.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  27.22 
 
 
483 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  27.59 
 
 
485 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  27.59 
 
 
494 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  27.43 
 
 
491 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  25.23 
 
 
493 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  26.59 
 
 
482 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  25.53 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  27.43 
 
 
491 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  27.43 
 
 
491 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  27.79 
 
 
488 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  23.57 
 
 
476 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  27.64 
 
 
488 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  25.31 
 
 
469 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  26.1 
 
 
509 aa  55.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  27.07 
 
 
488 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  27.41 
 
 
488 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1486  hypothetical protein  35.63 
 
 
216 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.963821  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.77 
 
 
425 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  26.37 
 
 
459 aa  51.2  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.41 
 
 
919 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0124  chlorophyllide reductase subunit Z  24.89 
 
 
469 aa  50.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.957131  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  23.39 
 
 
469 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4683  nitrogenase alpha chain  26.36 
 
 
524 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  19.82 
 
 
469 aa  49.3  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1871  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  30.68 
 
 
216 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0411663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  23.95 
 
 
476 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  25.52 
 
 
482 aa  47  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  22.69 
 
 
469 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1394  nitrogenase iron-iron protein, alpha chain  23.62 
 
 
519 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  23.93 
 
 
918 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  25.6 
 
 
518 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  33.94 
 
 
348 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  25.42 
 
 
919 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  32.08 
 
 
355 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3027  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.48 
 
 
917 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3206  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  25.48 
 
 
918 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1690  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  35.87 
 
 
208 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422709  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0855  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  31.87 
 
 
206 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000345785  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2077  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.2 
 
 
918 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3491  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  23.99 
 
 
919 aa  44.3  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.59 
 
 
541 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1521  nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha subunit  22.87 
 
 
491 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  25.47 
 
 
466 aa  43.9  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1239  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  22.87 
 
 
491 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1622  nitrogenase alpha chain  23.62 
 
 
522 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>