101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3256 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  100 
 
 
493 aa  1009    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  95.54 
 
 
493 aa  972    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  57.52 
 
 
493 aa  566  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  50.52 
 
 
469 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0124  chlorophyllide reductase subunit Z  51.04 
 
 
469 aa  487  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.957131  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  50.52 
 
 
469 aa  484  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  50.52 
 
 
468 aa  481  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1716  chlorophyllide reductase subunit Z  50.21 
 
 
468 aa  473  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  49.79 
 
 
469 aa  472  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  48.96 
 
 
469 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  41.51 
 
 
483 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  41.73 
 
 
483 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  41.93 
 
 
509 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  41.73 
 
 
482 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  41.29 
 
 
480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  41.13 
 
 
483 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  41.02 
 
 
482 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  39.88 
 
 
485 aa  348  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  40.57 
 
 
488 aa  347  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  38.49 
 
 
488 aa  345  8.999999999999999e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  39.96 
 
 
487 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  39.8 
 
 
491 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  39.8 
 
 
491 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  39.4 
 
 
491 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  38.68 
 
 
494 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  39.49 
 
 
488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  39.8 
 
 
488 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  39.49 
 
 
488 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.76 
 
 
507 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.79 
 
 
508 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.02 
 
 
508 aa  93.2  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.69 
 
 
508 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.6 
 
 
508 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.82 
 
 
508 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.51 
 
 
508 aa  90.1  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.27 
 
 
508 aa  83.6  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.8 
 
 
519 aa  80.5  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.26 
 
 
568 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.99 
 
 
535 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  25.14 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  23.45 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.05 
 
 
531 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.97 
 
 
533 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.79 
 
 
544 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.53 
 
 
531 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.54 
 
 
522 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.98 
 
 
532 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  25.24 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.86 
 
 
563 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  24.43 
 
 
452 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.11 
 
 
534 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.15 
 
 
535 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.11 
 
 
534 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.88 
 
 
526 aa  68.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  29.59 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.49 
 
 
525 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.49 
 
 
525 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.12 
 
 
535 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.64 
 
 
532 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.96 
 
 
540 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.72 
 
 
535 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  24.49 
 
 
444 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.93 
 
 
525 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.62 
 
 
541 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.19 
 
 
517 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.98 
 
 
541 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.77 
 
 
506 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.86 
 
 
530 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.43 
 
 
523 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.94 
 
 
530 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.34 
 
 
540 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.72 
 
 
480 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  24.48 
 
 
459 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.1 
 
 
528 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  20.42 
 
 
446 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.67 
 
 
508 aa  57  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.66 
 
 
523 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.15 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.07 
 
 
531 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.3 
 
 
526 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.25 
 
 
509 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.99 
 
 
525 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.24 
 
 
546 aa  53.5  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0772  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.66 
 
 
441 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.2 
 
 
536 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  22.27 
 
 
482 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  22.14 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2003  nitrogenase  21.99 
 
 
450 aa  51.2  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.577427  normal  0.745673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  24.21 
 
 
516 aa  50.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.05 
 
 
448 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  21.45 
 
 
509 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0772  nitrogenase  26.51 
 
 
451 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.24 
 
 
524 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  24.81 
 
 
448 aa  49.3  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  21.88 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  23.95 
 
 
515 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0551  nitrogenase component I, alpha chain  20.79 
 
 
486 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.39708  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1540  hypothetical protein  24.44 
 
 
406 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  23.28 
 
 
511 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1565  nitrogenase  22.47 
 
 
491 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.016954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>