220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2259 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.8 
 
 
563 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.38 
 
 
544 aa  648    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  71.62 
 
 
525 aa  798    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  81.19 
 
 
533 aa  899    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  72.04 
 
 
540 aa  800    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  71.88 
 
 
535 aa  810    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.24 
 
 
535 aa  794    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 
532 aa  1098    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.71 
 
 
568 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  71.21 
 
 
535 aa  795    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.19 
 
 
508 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.75 
 
 
508 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.01 
 
 
508 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.9 
 
 
508 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.9 
 
 
508 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.45 
 
 
508 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.64 
 
 
508 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.78 
 
 
507 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.3 
 
 
526 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.13 
 
 
530 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.09 
 
 
531 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.96 
 
 
531 aa  316  8e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.48 
 
 
540 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.52 
 
 
546 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.94 
 
 
517 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.45 
 
 
519 aa  310  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.85 
 
 
530 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.3 
 
 
532 aa  306  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.33 
 
 
525 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.33 
 
 
534 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.33 
 
 
534 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.96 
 
 
525 aa  299  8e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.76 
 
 
535 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.29 
 
 
525 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.09 
 
 
523 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.53 
 
 
524 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.02 
 
 
522 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.93 
 
 
541 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.78 
 
 
526 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.27 
 
 
528 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.3 
 
 
531 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.35 
 
 
523 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.5 
 
 
536 aa  286  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.33 
 
 
508 aa  282  9e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.46 
 
 
506 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.36 
 
 
541 aa  277  4e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.78 
 
 
480 aa  173  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  23.53 
 
 
402 aa  95.1  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.8 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  25.39 
 
 
494 aa  78.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.55 
 
 
541 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.97 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  24.81 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  25.53 
 
 
482 aa  74.3  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  25.32 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.81 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  22.12 
 
 
446 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  22.98 
 
 
493 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  25.69 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.17 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  25 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  28.86 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  30.9 
 
 
488 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  24.17 
 
 
485 aa  70.5  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  25.31 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  31.98 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  31.98 
 
 
491 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  23.04 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  22.6 
 
 
546 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.65 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  31.4 
 
 
491 aa  68.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  23.95 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  20.28 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  21.64 
 
 
505 aa  67  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  24.87 
 
 
469 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  25 
 
 
480 aa  66.6  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  22.47 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  29.78 
 
 
488 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  30.51 
 
 
487 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  22.45 
 
 
509 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.58 
 
 
545 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  29.21 
 
 
488 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  21.67 
 
 
917 aa  65.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.12 
 
 
461 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  23.12 
 
 
448 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  29.21 
 
 
488 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  28.86 
 
 
468 aa  63.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  25.72 
 
 
459 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  25.96 
 
 
493 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  23.99 
 
 
452 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24 
 
 
462 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.03 
 
 
463 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6878  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  22.22 
 
 
457 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.785272  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1540  hypothetical protein  24.8 
 
 
406 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  26.73 
 
 
469 aa  59.7  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  21.28 
 
 
460 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  22.19 
 
 
476 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.3 
 
 
448 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  23.99 
 
 
450 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  24.81 
 
 
511 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>