255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3719 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.13 
 
 		 532 aa  790    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.54 
 
 		 525 aa  637    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  63.96 
 
 		 534 aa  689    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  71.81 
 
 		 517 aa  731    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  73.53 
 
 		 508 aa  752    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  77.97 
 
 		 531 aa  811    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  69.63 
 
 		 540 aa  753    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  68.68 
 
 		 546 aa  729    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  78.3 
 
 		 530 aa  814    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 		 506 aa  1010    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  67.28 
 
 		 541 aa  728    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  63.17 
 
 		 519 aa  665    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.38 
 
 		 530 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  78.2 
 
 		 531 aa  813    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  67.91 
 
 		 535 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  62.8 
 
 		 528 aa  680    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  63.28 
 
 		 526 aa  657    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.73 
 
 		 525 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  63.96 
 
 		 534 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.91 
 
 		 522 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.06 
 
 		 531 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  63.57 
 
 		 524 aa  626  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.81 
 
 		 541 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.47 
 
 		 525 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.98 
 
 		 526 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.67 
 
 		 536 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.93 
 
 		 523 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.93 
 
 		 523 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.89 
 
 		 507 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.33 
 
 		 508 aa  326  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.05 
 
 		 508 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.05 
 
 		 508 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.24 
 
 		 508 aa  320  5e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.71 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.94 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.36 
 
 		 508 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.75 
 
 		 535 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.75 
 
 		 544 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.84 
 
 		 533 aa  307  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.88 
 
 		 563 aa  306  8.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.8 
 
 		 568 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.69 
 
 		 535 aa  300  5e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.73 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.08 
 
 		 532 aa  291  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.64 
 
 		 525 aa  289  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.96 
 
 		 535 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.2 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  30.11 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  29.08 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  28.1 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  27.34 
 
 		 488 aa  99.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  29.14 
 
 		 488 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  29.14 
 
 		 488 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  27.48 
 
 		 483 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  27.15 
 
 		 491 aa  93.6  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  27.55 
 
 		 480 aa  93.2  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  26.52 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  26.4 
 
 		 494 aa  92.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  27.17 
 
 		 491 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  25.2 
 
 		 462 aa  90.9  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  27.17 
 
 		 491 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  26.55 
 
 		 483 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  25.97 
 
 		 483 aa  90.1  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  28.37 
 
 		 488 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  24.73 
 
 		 462 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  24.46 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  27.19 
 
 		 482 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  24.12 
 
 		 462 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  20 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  24.36 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  26.98 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  26.52 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.24 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.54 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  29.23 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  24.73 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.91 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  22.52 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  21.08 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.89 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  24.01 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  25.87 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  23.34 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0551  nitrogenase component I, alpha chain  23.15 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.39708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.75 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.27 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  28.66 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  26.16 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  26.16 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  21.56 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0281  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.88 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0757727  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  24.91 
 
 		 430 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2887  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.46 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513277  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1431  nitrogenase component I, alpha chain  23.85 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.83 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  27.35 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  19.54 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  21.29 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  22.99 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>