179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0746 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  75.47 
 
 		 525 aa  836    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  78.74 
 
 		 541 aa  861    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 		 524 aa  1083    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.48 
 
 		 525 aa  777    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.61 
 
 		 546 aa  656    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.88 
 
 		 541 aa  646    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.84 
 
 		 530 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  75.33 
 
 		 531 aa  845    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.57 
 
 		 535 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  65.79 
 
 		 526 aa  686    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.94 
 
 		 523 aa  786    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.29 
 
 		 526 aa  784    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  75.89 
 
 		 525 aa  840    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  77.24 
 
 		 536 aa  839    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.69 
 
 		 523 aa  776    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  62.83 
 
 		 531 aa  647    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  63.41 
 
 		 517 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.07 
 
 		 540 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  63.24 
 
 		 508 aa  641    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  62.45 
 
 		 531 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.97 
 
 		 530 aa  634  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  62.08 
 
 		 532 aa  631  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.7 
 
 		 522 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.04 
 
 		 528 aa  624  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.47 
 
 		 534 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.47 
 
 		 534 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.13 
 
 		 519 aa  617  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  63.19 
 
 		 506 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.09 
 
 		 508 aa  315  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.61 
 
 		 508 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.28 
 
 		 508 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.35 
 
 		 507 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.28 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.28 
 
 		 508 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.99 
 
 		 544 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.82 
 
 		 535 aa  301  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.07 
 
 		 533 aa  301  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.77 
 
 		 508 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.29 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.7 
 
 		 508 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.41 
 
 		 563 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.28 
 
 		 568 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.23 
 
 		 535 aa  276  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32 
 
 		 535 aa  268  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.84 
 
 		 525 aa  263  6e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.25 
 
 		 540 aa  261  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.19 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  25.4 
 
 		 488 aa  99  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  23.41 
 
 		 482 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  23.13 
 
 		 482 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  23.22 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  24.72 
 
 		 488 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  24.72 
 
 		 488 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  23.17 
 
 		 485 aa  89.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  23.01 
 
 		 488 aa  89.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  26.42 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  24.38 
 
 		 487 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  23.59 
 
 		 494 aa  87.4  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  23.13 
 
 		 483 aa  87  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  23.43 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  24.32 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  24.81 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  22.94 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  28.5 
 
 		 491 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.43 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  21.44 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  28 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  30.53 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  24.52 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  17.62 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  22.64 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1431  nitrogenase component I, alpha chain  21.76 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  24.87 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  26.23 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  25.9 
 
 		 463 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  23.58 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  22.34 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  22.8 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  23.58 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  21.79 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  23 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.99 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  24.94 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  26.32 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  23.91 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  30.89 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.82 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0062  nitrogenase alpha chain  22.06 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.22 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0551  nitrogenase component I, alpha chain  23.75 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.39708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  23.23 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  21.91 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  23.06 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  21.29 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2908  Nitrogenase  23.13 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  21.81 
 
 		 545 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.57 
 
 		 516 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.13 
 
 		 513 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.86 
 
 		 466 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  19.35 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>