215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0216 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  69.79 
 
 
533 aa  785    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  77.94 
 
 
535 aa  880    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 
525 aa  1082    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.61 
 
 
540 aa  863    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  80.19 
 
 
535 aa  892    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.62 
 
 
563 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.68 
 
 
535 aa  865    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  71.4 
 
 
532 aa  792    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.89 
 
 
568 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.32 
 
 
544 aa  619  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.7 
 
 
508 aa  375  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.76 
 
 
508 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.71 
 
 
507 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.69 
 
 
508 aa  360  5e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.89 
 
 
508 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.58 
 
 
508 aa  359  7e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.51 
 
 
508 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.33 
 
 
508 aa  346  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.7 
 
 
546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.44 
 
 
526 aa  302  9e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.09 
 
 
522 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.03 
 
 
531 aa  292  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.98 
 
 
530 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.4 
 
 
540 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.37 
 
 
534 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.37 
 
 
534 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.18 
 
 
530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.21 
 
 
519 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.18 
 
 
531 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.07 
 
 
506 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.06 
 
 
532 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.63 
 
 
535 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.4 
 
 
517 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.97 
 
 
508 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.21 
 
 
541 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.04 
 
 
528 aa  272  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.22 
 
 
525 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.91 
 
 
541 aa  267  4e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.52 
 
 
531 aa  266  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.47 
 
 
524 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.22 
 
 
525 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.55 
 
 
526 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.19 
 
 
525 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.6 
 
 
523 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.79 
 
 
536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.74 
 
 
523 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.98 
 
 
480 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  22.57 
 
 
402 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.79 
 
 
466 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  25.48 
 
 
483 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  25.54 
 
 
482 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  25.12 
 
 
482 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  25.24 
 
 
483 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  26.24 
 
 
448 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.84 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1566  nitrogenase  24.73 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.28 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  23.28 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.49 
 
 
460 aa  68.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.99 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.43 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  27.27 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  23.97 
 
 
511 aa  67  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  30.81 
 
 
494 aa  67  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.8 
 
 
455 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  26.64 
 
 
491 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  23.13 
 
 
469 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  24.63 
 
 
483 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  22.12 
 
 
493 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  27.35 
 
 
491 aa  64.3  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.46 
 
 
485 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  24.11 
 
 
509 aa  64.3  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  27.35 
 
 
491 aa  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  24.54 
 
 
466 aa  63.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1540  hypothetical protein  29.9 
 
 
406 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  19.92 
 
 
509 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.2 
 
 
459 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.02 
 
 
460 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.45 
 
 
459 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  24.6 
 
 
488 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  23.48 
 
 
487 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  24.06 
 
 
462 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  22.3 
 
 
493 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  24.29 
 
 
485 aa  61.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  18.96 
 
 
425 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  27.25 
 
 
422 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.08 
 
 
465 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  24.35 
 
 
452 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2888  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.89 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  21.98 
 
 
505 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  22.96 
 
 
469 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  26.42 
 
 
511 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  21.55 
 
 
456 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.71 
 
 
460 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  20.94 
 
 
469 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3096  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  24.8 
 
 
546 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.659275  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0680  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.47 
 
 
455 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  25.46 
 
 
480 aa  57.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  22.26 
 
 
444 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  21.86 
 
 
917 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>