238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3466 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  82.28 
 
 
507 aa  906    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  86.81 
 
 
508 aa  944    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 
508 aa  1059    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.18 
 
 
508 aa  847    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  87.4 
 
 
508 aa  951    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  87.2 
 
 
508 aa  938    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  93.11 
 
 
508 aa  998    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  85.63 
 
 
508 aa  943    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.56 
 
 
544 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.02 
 
 
568 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.13 
 
 
563 aa  382  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.9 
 
 
532 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.17 
 
 
533 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.21 
 
 
535 aa  363  3e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.14 
 
 
525 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.96 
 
 
535 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.23 
 
 
535 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.52 
 
 
540 aa  352  8e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.01 
 
 
526 aa  343  5e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.06 
 
 
530 aa  330  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.85 
 
 
517 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.46 
 
 
531 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.52 
 
 
531 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.4 
 
 
525 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.4 
 
 
525 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.64 
 
 
540 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.89 
 
 
519 aa  309  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.62 
 
 
522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.07 
 
 
508 aa  307  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.23 
 
 
528 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.08 
 
 
530 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.97 
 
 
532 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.39 
 
 
541 aa  303  7.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.32 
 
 
535 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.28 
 
 
524 aa  300  5e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.21 
 
 
541 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.52 
 
 
523 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.36 
 
 
506 aa  297  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.21 
 
 
525 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.77 
 
 
526 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.52 
 
 
531 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.94 
 
 
534 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.94 
 
 
534 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.71 
 
 
523 aa  296  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.08 
 
 
546 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.78 
 
 
536 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.24 
 
 
480 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  23.15 
 
 
402 aa  107  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  24.72 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  24.69 
 
 
482 aa  93.6  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  24.94 
 
 
466 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  25.16 
 
 
460 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  22.82 
 
 
493 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  25.53 
 
 
469 aa  90.1  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  22.69 
 
 
483 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  23.21 
 
 
493 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  25.76 
 
 
483 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  23.36 
 
 
469 aa  87.8  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  24.24 
 
 
483 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  25.71 
 
 
494 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.74 
 
 
509 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  24.86 
 
 
488 aa  84  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  24.72 
 
 
488 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  28.32 
 
 
511 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  24.43 
 
 
488 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  26.87 
 
 
463 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  22.25 
 
 
482 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  22.4 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  24.94 
 
 
491 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  21.94 
 
 
485 aa  80.1  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  23.15 
 
 
493 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  25 
 
 
459 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  24.68 
 
 
491 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  23.3 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  23.53 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  24.68 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  22.82 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  26.95 
 
 
515 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  23.82 
 
 
488 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.84 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  23.62 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.74 
 
 
546 aa  73.6  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  23.01 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  21.76 
 
 
509 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.46 
 
 
462 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  25.82 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.69 
 
 
541 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.33 
 
 
455 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0124  chlorophyllide reductase subunit Z  22.76 
 
 
469 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.957131  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  22.79 
 
 
509 aa  71.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25 
 
 
467 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  25.39 
 
 
516 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  22.74 
 
 
448 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  27.94 
 
 
430 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  21.37 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  22.7 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.61 
 
 
466 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.68 
 
 
465 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02610  vanadium nitrogenase, alpha subunit, vnfD  21.67 
 
 
474 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4026  nitrogenase vanadium-iron protein, alpha chain  21.14 
 
 
587 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>