74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2500 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1716  chlorophyllide reductase subunit Z  68.44 
 
 		 468 aa  675    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  75.43 
 
 		 469 aa  758    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  70.58 
 
 		 469 aa  701    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  69.3 
 
 		 469 aa  687    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  76.34 
 
 		 468 aa  742    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0124  chlorophyllide reductase subunit Z  72.96 
 
 		 469 aa  725    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.957131  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  100 
 
 		 469 aa  974    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  50.52 
 
 		 493 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  50.52 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  43.24 
 
 		 493 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  39 
 
 		 482 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  39.38 
 
 		 482 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  39.29 
 
 		 483 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  38.88 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  37.21 
 
 		 485 aa  346  5e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  36.59 
 
 		 483 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  37.95 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  38.28 
 
 		 487 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  34.98 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  36.89 
 
 		 491 aa  329  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  35.73 
 
 		 509 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  36.88 
 
 		 488 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  35.86 
 
 		 491 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  35.86 
 
 		 491 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  36.66 
 
 		 488 aa  326  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  37 
 
 		 488 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  34.43 
 
 		 494 aa  319  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  36.62 
 
 		 488 aa  317  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.8 
 
 		 508 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.53 
 
 		 508 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.72 
 
 		 508 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.56 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.19 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.75 
 
 		 507 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.43 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.61 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.91 
 
 		 568 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.78 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.39 
 
 		 563 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  20.94 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.94 
 
 		 541 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.15 
 
 		 535 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.3 
 
 		 535 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.17 
 
 		 531 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.53 
 
 		 531 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.63 
 
 		 448 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.36 
 
 		 541 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.84 
 
 		 540 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  19.68 
 
 		 446 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  23.33 
 
 		 466 aa  53.5  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.48 
 
 		 544 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.71 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.22 
 
 		 532 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.31 
 
 		 526 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.02 
 
 		 519 aa  50.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  21.64 
 
 		 463 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.98 
 
 		 525 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.85 
 
 		 530 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.25 
 
 		 509 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  24.71 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.57 
 
 		 534 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.57 
 
 		 534 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  21.84 
 
 		 460 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.59 
 
 		 536 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.25 
 
 		 522 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.59 
 
 		 517 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.21 
 
 		 532 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  17.96 
 
 		 731 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.19 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.52 
 
 		 535 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.51 
 
 		 525 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.51 
 
 		 525 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.97 
 
 		 528 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.25 
 
 		 531 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>