276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0286 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.54 
 
 		 540 aa  719    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.01 
 
 		 506 aa  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  65.56 
 
 		 530 aa  701    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 		 534 aa  1093    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.91 
 
 		 531 aa  716    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.11 
 
 		 541 aa  636    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.54 
 
 		 531 aa  711    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  89.33 
 
 		 522 aa  989    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.7 
 
 		 546 aa  709    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.79 
 
 		 532 aa  701    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66 
 
 		 541 aa  708    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  72.47 
 
 		 519 aa  796    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.23 
 
 		 530 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  65.69 
 
 		 535 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  65.87 
 
 		 517 aa  710    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  99.63 
 
 		 534 aa  1090    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.21 
 
 		 508 aa  684    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  74.39 
 
 		 528 aa  828    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.37 
 
 		 526 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.96 
 
 		 525 aa  638    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.78 
 
 		 525 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.56 
 
 		 531 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.47 
 
 		 524 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.58 
 
 		 536 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  54.63 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  54.45 
 
 		 523 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  53.99 
 
 		 526 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  53.36 
 
 		 523 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.38 
 
 		 533 aa  322  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.57 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.85 
 
 		 535 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.33 
 
 		 508 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.93 
 
 		 544 aa  310  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.8 
 
 		 563 aa  310  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.64 
 
 		 507 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.28 
 
 		 568 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.24 
 
 		 540 aa  306  6e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.21 
 
 		 508 aa  306  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.12 
 
 		 508 aa  306  9.000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.61 
 
 		 535 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.6 
 
 		 535 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.85 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.55 
 
 		 508 aa  299  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.58 
 
 		 508 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.63 
 
 		 532 aa  297  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.79 
 
 		 525 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.91 
 
 		 480 aa  151  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  21.84 
 
 		 402 aa  93.2  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  24.49 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  20.19 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  26.48 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  28.48 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  26.83 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  26.53 
 
 		 488 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  24.28 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.91 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  25.35 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  29.62 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  26.53 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  24.74 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  24.74 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  31.82 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  24.74 
 
 		 462 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  28.82 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  28.17 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  26.91 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  26.65 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  23.98 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  21.96 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.98 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  26.46 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  26 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  25.75 
 
 		 480 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.89 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  24.17 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  26.55 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  22.01 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  29.26 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  23.53 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  23.75 
 
 		 451 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  25.81 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  24.01 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  24.72 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  21.93 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  24.1 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.82 
 
 		 518 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.3 
 
 		 455 aa  67  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  26.74 
 
 		 347 aa  67  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.09 
 
 		 461 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.29 
 
 		 511 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.29 
 
 		 511 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  23.24 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  29.82 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.61 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.59 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  25.57 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  28.16 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.93 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  25.58 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>