202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2387 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.5 
 
 
532 aa  781    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  81.31 
 
 
535 aa  905    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  81.75 
 
 
535 aa  914    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.82 
 
 
525 aa  864    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.77 
 
 
563 aa  648    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  78.14 
 
 
540 aa  880    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 
535 aa  1109    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.54 
 
 
568 aa  638    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  71 
 
 
533 aa  800    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.43 
 
 
544 aa  609  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.32 
 
 
507 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.78 
 
 
508 aa  363  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.7 
 
 
508 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.51 
 
 
508 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.51 
 
 
508 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.15 
 
 
508 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.23 
 
 
508 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.6 
 
 
508 aa  350  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.7 
 
 
546 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.53 
 
 
526 aa  303  7.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.89 
 
 
522 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.52 
 
 
519 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.6 
 
 
534 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.42 
 
 
534 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.89 
 
 
531 aa  294  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.54 
 
 
531 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.19 
 
 
517 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.78 
 
 
530 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.04 
 
 
540 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.7 
 
 
530 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.3 
 
 
532 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.89 
 
 
528 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.88 
 
 
508 aa  280  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.73 
 
 
526 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32 
 
 
525 aa  277  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.1 
 
 
541 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.5 
 
 
535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.23 
 
 
524 aa  274  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.44 
 
 
525 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.58 
 
 
506 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.15 
 
 
531 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.68 
 
 
541 aa  269  8e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.44 
 
 
525 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.62 
 
 
523 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.09 
 
 
536 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.88 
 
 
523 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.19 
 
 
480 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.23 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  25.78 
 
 
483 aa  73.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  25.56 
 
 
483 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  23.7 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  25.34 
 
 
482 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  27.2 
 
 
491 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.91 
 
 
461 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  23.21 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  25.81 
 
 
488 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  27.2 
 
 
491 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  20.29 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  24.57 
 
 
509 aa  67.8  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  26.36 
 
 
491 aa  67.4  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  24.53 
 
 
494 aa  67  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.49 
 
 
410 aa  67  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  21 
 
 
917 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  23.12 
 
 
493 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  26.75 
 
 
483 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.57 
 
 
463 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  26.53 
 
 
493 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1540  hypothetical protein  30.41 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  22.92 
 
 
466 aa  63.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  23.05 
 
 
444 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  39.81 
 
 
488 aa  62  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  22.19 
 
 
919 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  37.5 
 
 
480 aa  61.6  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  20.15 
 
 
459 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.6 
 
 
509 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  27.84 
 
 
469 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  26.98 
 
 
469 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0680  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.95 
 
 
455 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  19.29 
 
 
425 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  39.58 
 
 
488 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  24.69 
 
 
493 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.2 
 
 
448 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  24.8 
 
 
487 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  22.39 
 
 
485 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  38.54 
 
 
488 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1954  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.29 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.396368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  22.93 
 
 
511 aa  58.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  23.26 
 
 
460 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  20.9 
 
 
476 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1566  nitrogenase  21.15 
 
 
447 aa  57.4  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1756  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.68 
 
 
453 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00502819  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.59 
 
 
458 aa  57  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  38.54 
 
 
488 aa  57  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1249  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.77 
 
 
453 aa  57  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.265854  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.51 
 
 
428 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  23.3 
 
 
469 aa  57  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  21.47 
 
 
919 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  19.79 
 
 
455 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.43 
 
 
462 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  32.56 
 
 
459 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>