151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1540 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1540  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  828    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0406  hypothetical protein  35.8 
 
 
391 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1039  hypothetical protein  34.84 
 
 
387 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.451358  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2003  nitrogenase  27.32 
 
 
450 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.577427  normal  0.745673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.13 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.96 
 
 
508 aa  70.1  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.41 
 
 
535 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.25 
 
 
508 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  25.24 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1533  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.57 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.936667  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.24 
 
 
508 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.72 
 
 
533 aa  67  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.57 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1954  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.34 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.396368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  25.97 
 
 
518 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1632  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.85 
 
 
453 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00463409  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0663  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.23 
 
 
478 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.9 
 
 
544 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0680  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.76 
 
 
455 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1153  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.4 
 
 
454 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0447596  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  23.85 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1249  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.53 
 
 
453 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.265854  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.89 
 
 
542 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.95 
 
 
535 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.9 
 
 
525 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.32 
 
 
508 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.98 
 
 
465 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.35 
 
 
540 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0103  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.94 
 
 
480 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.21101  normal  0.23619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.33 
 
 
507 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.41 
 
 
535 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.92 
 
 
508 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.77 
 
 
462 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2888  oxidoreductase/nitrogenase component 1  32.24 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.92 
 
 
568 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1798  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.17 
 
 
480 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  22.86 
 
 
541 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1756  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.49 
 
 
453 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00502819  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  23.04 
 
 
467 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  28.63 
 
 
463 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.61 
 
 
506 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0841  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.35 
 
 
462 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  24.65 
 
 
469 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.81 
 
 
544 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.8 
 
 
532 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.97 
 
 
526 aa  60.5  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.33 
 
 
563 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  24.17 
 
 
452 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.94 
 
 
508 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.81 
 
 
545 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.42 
 
 
508 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.53 
 
 
355 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  21.6 
 
 
476 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4051  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.79 
 
 
456 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.283872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.42 
 
 
528 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.14 
 
 
539 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.32 
 
 
540 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.12 
 
 
508 aa  57.4  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1013  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.65 
 
 
456 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153138  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  21.8 
 
 
551 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.25 
 
 
534 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.25 
 
 
534 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.4 
 
 
522 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  28.87 
 
 
460 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.76 
 
 
523 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.49 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  23.67 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.82 
 
 
348 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.52 
 
 
523 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  24.1 
 
 
509 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.73 
 
 
531 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  25.91 
 
 
459 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  23.65 
 
 
425 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  26.83 
 
 
339 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  24.1 
 
 
476 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  20.85 
 
 
546 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  24.55 
 
 
515 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.37 
 
 
532 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.21 
 
 
430 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  20.94 
 
 
544 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0023858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02770  nitrogenase vanadium iron cofactor biosynthesis protein vnfE  22.64 
 
 
469 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687288  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.94 
 
 
536 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0772  nitrogenase  27.88 
 
 
451 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  23.56 
 
 
917 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0476  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  26.54 
 
 
629 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  24.15 
 
 
431 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3096  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  26.67 
 
 
546 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.659275  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.53 
 
 
526 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2620  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  23.32 
 
 
474 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  24.84 
 
 
493 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.82 
 
 
531 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  24.62 
 
 
476 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  25.49 
 
 
459 aa  50.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4485  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  24.88 
 
 
456 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0062  nitrogenase alpha chain  21.91 
 
 
475 aa  50.1  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.17 
 
 
530 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.35 
 
 
539 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  21.72 
 
 
919 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  22.38 
 
 
546 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  23.72 
 
 
482 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>