230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1838 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.77 
 
 
508 aa  850    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.77 
 
 
508 aa  851    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.18 
 
 
508 aa  847    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  78.54 
 
 
507 aa  844    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 
508 aa  1059    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  75.59 
 
 
508 aa  837    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  77.76 
 
 
508 aa  863    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.97 
 
 
508 aa  853    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.82 
 
 
544 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.12 
 
 
533 aa  381  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.82 
 
 
568 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.45 
 
 
532 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.93 
 
 
563 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.51 
 
 
535 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.15 
 
 
535 aa  365  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.15 
 
 
535 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.14 
 
 
525 aa  345  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.58 
 
 
526 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.82 
 
 
540 aa  343  5e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.29 
 
 
517 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.35 
 
 
530 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.41 
 
 
540 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.04 
 
 
531 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.04 
 
 
531 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.75 
 
 
508 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.18 
 
 
522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.57 
 
 
534 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.51 
 
 
530 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.57 
 
 
534 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.87 
 
 
535 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.22 
 
 
525 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.22 
 
 
525 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.05 
 
 
528 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.43 
 
 
541 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.24 
 
 
506 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.61 
 
 
524 aa  306  7e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.01 
 
 
532 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.07 
 
 
531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.94 
 
 
541 aa  303  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.33 
 
 
519 aa  300  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.52 
 
 
525 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.08 
 
 
526 aa  295  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.5 
 
 
536 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.08 
 
 
523 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.08 
 
 
523 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.26 
 
 
546 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.36 
 
 
480 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  23.15 
 
 
402 aa  121  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  28.49 
 
 
487 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  25.44 
 
 
482 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  25.25 
 
 
483 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  23.79 
 
 
485 aa  95.1  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  25.25 
 
 
483 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  25.84 
 
 
483 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.23 
 
 
509 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  24.61 
 
 
509 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  24.29 
 
 
494 aa  87.8  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  25 
 
 
488 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  25.9 
 
 
482 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  25 
 
 
488 aa  87  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  24.86 
 
 
460 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  25.59 
 
 
488 aa  87  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  22.95 
 
 
469 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.36 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  25.19 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  25.19 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  24.88 
 
 
466 aa  84  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  24.27 
 
 
493 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  25.19 
 
 
491 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  26.22 
 
 
463 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  24.22 
 
 
493 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  23.61 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.91 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  24.02 
 
 
480 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.69 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0124  chlorophyllide reductase subunit Z  23.95 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.957131  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  25.38 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  24.38 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  22.42 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  26.21 
 
 
488 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  23.73 
 
 
431 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  22.32 
 
 
539 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  23.41 
 
 
509 aa  72.8  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  19.12 
 
 
476 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  22.95 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1540  hypothetical protein  26.96 
 
 
406 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.37 
 
 
465 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  22.61 
 
 
546 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4026  nitrogenase vanadium-iron protein, alpha chain  21.11 
 
 
587 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.12 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  22.02 
 
 
545 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  20.73 
 
 
544 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6222  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  23.38 
 
 
475 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02610  vanadium nitrogenase, alpha subunit, vnfD  19.81 
 
 
474 aa  66.6  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.66 
 
 
462 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  20.05 
 
 
476 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  27.64 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  25.63 
 
 
511 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  20.53 
 
 
477 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1716  chlorophyllide reductase subunit Z  22.22 
 
 
468 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>