More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0093 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  100 
 
 
511 aa  1060    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  79.6 
 
 
515 aa  860    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1998  nitrogenase  66.4 
 
 
512 aa  736    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  68.86 
 
 
516 aa  766    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2908  Nitrogenase  35.95 
 
 
502 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  34.72 
 
 
511 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1565  nitrogenase  33.79 
 
 
491 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.016954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2592  Nitrogenase  33.33 
 
 
511 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  30.86 
 
 
501 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0773  nitrogenase  30.41 
 
 
487 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  27.43 
 
 
505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  29.18 
 
 
509 aa  143  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  29.54 
 
 
509 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.59 
 
 
476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0103  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.75 
 
 
480 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.21101  normal  0.23619 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1531  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.83 
 
 
546 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0168  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.49 
 
 
533 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488812  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0101  nitrogenase alpha chain  26.05 
 
 
476 aa  123  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299285  normal  0.0821221 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0661  nitrogenase alpha chain  25.65 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.949804  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1798  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.48 
 
 
480 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  30.4 
 
 
446 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0663  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.56 
 
 
478 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0682  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.88 
 
 
546 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0741  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.88 
 
 
546 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1800  nitrogenase alpha chain  25.75 
 
 
477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.515019  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.57 
 
 
544 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0023858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0551  nitrogenase component I, alpha chain  25.63 
 
 
486 aa  116  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.39708  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1952  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.57 
 
 
544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0543638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.23 
 
 
540 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1786  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.56 
 
 
476 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  29.59 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1814  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.56 
 
 
476 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  26.95 
 
 
482 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2887  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.58 
 
 
452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.08 
 
 
551 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1630  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.66 
 
 
542 aa  109  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000671543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  23.13 
 
 
476 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1954  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.99 
 
 
453 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.396368  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4796  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  27.78 
 
 
462 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.933705  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.54 
 
 
544 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.77 
 
 
546 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  27.42 
 
 
731 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.97 
 
 
541 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0062  nitrogenase alpha chain  24.66 
 
 
475 aa  107  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  27.3 
 
 
518 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.31 
 
 
545 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1414  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain:nitrogenase component I, alpha chain  24.94 
 
 
490 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.53 
 
 
470 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.615494  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1431  nitrogenase component I, alpha chain  25.98 
 
 
475 aa  103  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1788  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.53 
 
 
470 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2119  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.65 
 
 
476 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0308502 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  23.92 
 
 
472 aa  103  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4462  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  29.11 
 
 
503 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4248  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.2 
 
 
491 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5053  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.62 
 
 
509 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  29.07 
 
 
542 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.28 
 
 
448 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.22 
 
 
546 aa  100  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4931  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.4 
 
 
503 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.99 
 
 
539 aa  100  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  26.28 
 
 
463 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.03 
 
 
462 aa  100  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  26.03 
 
 
490 aa  99  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3932  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  27.47 
 
 
480 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.844513  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1632  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.31 
 
 
453 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00463409  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1239  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.74 
 
 
491 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291496 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1521  nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha subunit  27.74 
 
 
491 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1533  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.97 
 
 
453 aa  98.2  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.936667  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4137  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.6 
 
 
485 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.303688  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6224  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.99 
 
 
500 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1153  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  27.24 
 
 
454 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0447596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5100  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.97 
 
 
487 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3995  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.04 
 
 
505 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.22 
 
 
448 aa  97.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3917  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.81 
 
 
480 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4251  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  26.1 
 
 
905 aa  97.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4139  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  27.92 
 
 
936 aa  96.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1201  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.53 
 
 
479 aa  96.7  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75707  hitchhiker  0.00777378 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1353  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit alpha  25.13 
 
 
500 aa  96.7  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1249  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.68 
 
 
453 aa  96.7  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.265854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2365  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.88 
 
 
494 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0230  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.73 
 
 
486 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.403364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3535  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.67 
 
 
505 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330335  normal  0.0313062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  27.95 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  26.73 
 
 
458 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2620  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  24.87 
 
 
474 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2075  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.32 
 
 
487 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2344  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.9 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0441193  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  23.54 
 
 
476 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2144  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.32 
 
 
480 aa  95.1  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3631  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.84 
 
 
488 aa  95.1  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.486898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2099  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.69 
 
 
486 aa  95.1  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4485  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  28.27 
 
 
456 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1074  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.73 
 
 
487 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811234  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1350  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.12 
 
 
455 aa  94.4  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1028  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.95 
 
 
504 aa  94.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0970  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.2 
 
 
487 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659095  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01390  Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain:Nitrogenase component I, alpha chain  24.47 
 
 
492 aa  94  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1431  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.99 
 
 
485 aa  94  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  27.05 
 
 
465 aa  94  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>