231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5100 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1521  nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha subunit  82.18 
 
 
491 aa  838    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3631  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  86.24 
 
 
488 aa  886    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.486898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2820  nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha chain  63.58 
 
 
479 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0230  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  87.16 
 
 
486 aa  884    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.403364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1414  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain:nitrogenase component I, alpha chain  76.26 
 
 
490 aa  773    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0089  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  84.63 
 
 
501 aa  875    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01390  Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain:Nitrogenase component I, alpha chain  74.16 
 
 
492 aa  754    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2075  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  64.98 
 
 
487 aa  660    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3917  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  71.74 
 
 
480 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  82.12 
 
 
487 aa  839    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3535  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  75.36 
 
 
505 aa  767    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330335  normal  0.0313062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1569  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  77.8 
 
 
499 aa  798    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.825856  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4248  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  74.47 
 
 
491 aa  762    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1814  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  75.32 
 
 
476 aa  772    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1353  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit alpha  73.31 
 
 
500 aa  778    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0540  nitrogenase iron-molybdenum protein, alpha chain  74.08 
 
 
493 aa  767    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2099  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  64.98 
 
 
486 aa  670    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0649  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  62.14 
 
 
481 aa  658    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.997162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2365  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  73.01 
 
 
494 aa  771    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4931  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  72.92 
 
 
503 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0663  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.17 
 
 
481 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.508011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1431  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  82.75 
 
 
485 aa  845    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2144  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  64.98 
 
 
480 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1011  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  76.05 
 
 
487 aa  778    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.77042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2119  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  75.96 
 
 
476 aa  776    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0308502 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1239  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  82.18 
 
 
491 aa  838    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4487  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  68.18 
 
 
486 aa  706    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493572  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0970  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  95.48 
 
 
487 aa  976    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659095  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1786  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  75.32 
 
 
476 aa  772    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4462  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  88.91 
 
 
503 aa  918    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6224  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  74.84 
 
 
500 aa  765    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1466  nitrogenase, molybdenum-iron protein alpha chain(NifD)  82.34 
 
 
487 aa  844    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00189861  hitchhiker  0.000541069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1074  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  95.28 
 
 
487 aa  975    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811234  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4137  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  71.64 
 
 
485 aa  761    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.303688  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5053  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  73.54 
 
 
509 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1201  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  76.26 
 
 
479 aa  764    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75707  hitchhiker  0.00777378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3468  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.17 
 
 
481 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0492  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  72.48 
 
 
482 aa  751    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3204  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.58 
 
 
483 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1050  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  64.09 
 
 
477 aa  680    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2344  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  83.99 
 
 
487 aa  855    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0441193  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0273  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  71.22 
 
 
488 aa  728    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5100  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  100 
 
 
487 aa  1005    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2191  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  74.08 
 
 
493 aa  766    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395448  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6880  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  67.98 
 
 
486 aa  709    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3029  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  64.35 
 
 
483 aa  662    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0474  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  82.92 
 
 
486 aa  856    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387575  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  74.49 
 
 
493 aa  769    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.867808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1176  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  65.23 
 
 
479 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3995  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  74.53 
 
 
505 aa  761    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5924  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain, nifD  84.43 
 
 
500 aa  869    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0168  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.84 
 
 
533 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488812  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1531  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.23 
 
 
546 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.62 
 
 
539 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1630  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.23 
 
 
542 aa  401  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000671543  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.99 
 
 
544 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0023858  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  41.48 
 
 
541 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0741  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.12 
 
 
546 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0682  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.15 
 
 
546 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.16 
 
 
545 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.31 
 
 
540 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1952  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.59 
 
 
544 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0543638  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.11 
 
 
546 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.42 
 
 
542 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38 
 
 
544 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.89 
 
 
551 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.31 
 
 
539 aa  358  9e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.01 
 
 
546 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  40.78 
 
 
476 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  40.26 
 
 
482 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0551  nitrogenase component I, alpha chain  40.34 
 
 
486 aa  330  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.39708  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1431  nitrogenase component I, alpha chain  38.48 
 
 
475 aa  329  6e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  40.88 
 
 
476 aa  320  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0101  nitrogenase alpha chain  39.06 
 
 
476 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299285  normal  0.0821221 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0661  nitrogenase alpha chain  38.84 
 
 
476 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.949804  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1800  nitrogenase alpha chain  38.97 
 
 
477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.515019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0062  nitrogenase alpha chain  37.85 
 
 
475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  38.55 
 
 
476 aa  301  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0103  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  35.65 
 
 
480 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.21101  normal  0.23619 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0663  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  36.68 
 
 
478 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4026  nitrogenase vanadium-iron protein, alpha chain  36.82 
 
 
587 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1798  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  36.21 
 
 
480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  34.48 
 
 
518 aa  289  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  35.5 
 
 
465 aa  280  4e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  35.21 
 
 
917 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2077  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.99 
 
 
918 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.31 
 
 
918 aa  273  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  35.08 
 
 
462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2278  nitrogenase, subunit alpha  35.65 
 
 
465 aa  269  7e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000740744  normal  0.119504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3932  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  35.38 
 
 
480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.844513  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  33.26 
 
 
915 aa  266  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  34.44 
 
 
470 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.615494  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1788  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  34.44 
 
 
470 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3206  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  33.41 
 
 
918 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3027  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  33.77 
 
 
917 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02610  vanadium nitrogenase, alpha subunit, vnfD  33.91 
 
 
474 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  32.01 
 
 
459 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4796  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  33.73 
 
 
462 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.933705  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4139  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  35.61 
 
 
936 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  32.11 
 
 
919 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>