220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2820 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0492  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.29 
 
 
482 aa  652    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2820  nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha chain  100 
 
 
479 aa  995    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0230  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.58 
 
 
486 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.403364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1414  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain:nitrogenase component I, alpha chain  64.42 
 
 
490 aa  656    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1814  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  66.1 
 
 
476 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5100  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.58 
 
 
487 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1521  nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha subunit  64.5 
 
 
491 aa  651    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6880  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.27 
 
 
486 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2119  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  65.47 
 
 
476 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0308502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4248  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.85 
 
 
491 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01390  Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain:Nitrogenase component I, alpha chain  62.63 
 
 
492 aa  650    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2099  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  76.63 
 
 
486 aa  787    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1239  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  64.5 
 
 
491 aa  651    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0663  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  83.78 
 
 
481 aa  862    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.508011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2144  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  85.21 
 
 
480 aa  871    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1011  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  62.71 
 
 
487 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.77042  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3631  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.77 
 
 
488 aa  648    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.486898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4487  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.27 
 
 
486 aa  646    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493572  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0970  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.17 
 
 
487 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659095  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1786  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  66.1 
 
 
476 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4462  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.45 
 
 
503 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2075  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  85.42 
 
 
487 aa  876    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1050  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  68.01 
 
 
477 aa  677    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1074  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.17 
 
 
487 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811234  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4137  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  64.21 
 
 
485 aa  654    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.303688  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3204  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  83.61 
 
 
483 aa  851    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1201  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  65.26 
 
 
479 aa  671    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75707  hitchhiker  0.00777378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3468  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  84.2 
 
 
481 aa  868    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2344  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.58 
 
 
487 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0441193  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0273  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.73 
 
 
488 aa  658    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280105  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0474  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.86 
 
 
486 aa  651    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387575  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0089  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  64.55 
 
 
501 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3029  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  84.45 
 
 
483 aa  867    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.16 
 
 
487 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1353  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit alpha  63.87 
 
 
500 aa  650    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2365  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.77 
 
 
494 aa  635    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1176  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  88.31 
 
 
479 aa  907    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5924  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain, nifD  64.34 
 
 
500 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0649  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  79.63 
 
 
481 aa  832    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.997162  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0540  nitrogenase iron-molybdenum protein, alpha chain  62.32 
 
 
493 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1466  nitrogenase, molybdenum-iron protein alpha chain(NifD)  62.76 
 
 
487 aa  631  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00189861  hitchhiker  0.000541069 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2191  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  62.73 
 
 
493 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395448  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1569  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  62.84 
 
 
499 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.825856  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1431  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  62.74 
 
 
485 aa  630  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  61.2 
 
 
493 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.867808 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6224  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  61.47 
 
 
500 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5053  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  60.47 
 
 
509 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4931  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  59.66 
 
 
503 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3535  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  59.79 
 
 
505 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330335  normal  0.0313062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3917  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.41 
 
 
480 aa  608  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3995  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  58.96 
 
 
505 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0168  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  42.5 
 
 
533 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488812  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  41.65 
 
 
542 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0741  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  42.2 
 
 
546 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.89 
 
 
544 aa  411  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0023858  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0682  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  41.81 
 
 
546 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.65 
 
 
545 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1531  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  41.86 
 
 
546 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.04 
 
 
541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.35 
 
 
539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1952  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  41.17 
 
 
544 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0543638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.92 
 
 
540 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1630  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.12 
 
 
542 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000671543  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.19 
 
 
539 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.7 
 
 
544 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.03 
 
 
546 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.66 
 
 
551 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.36 
 
 
546 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1431  nitrogenase component I, alpha chain  41.51 
 
 
475 aa  342  9e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  40.05 
 
 
476 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  41.91 
 
 
482 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  40.73 
 
 
476 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0101  nitrogenase alpha chain  40.09 
 
 
476 aa  330  4e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299285  normal  0.0821221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0551  nitrogenase component I, alpha chain  39.44 
 
 
486 aa  329  8e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.39708  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1800  nitrogenase alpha chain  39.64 
 
 
477 aa  326  5e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.515019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0661  nitrogenase alpha chain  39.64 
 
 
476 aa  326  6e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.949804  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0062  nitrogenase alpha chain  39.08 
 
 
475 aa  322  6e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0103  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  37.25 
 
 
480 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.21101  normal  0.23619 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1798  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  36.54 
 
 
480 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0663  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  36.32 
 
 
478 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  36.85 
 
 
476 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4026  nitrogenase vanadium-iron protein, alpha chain  38.55 
 
 
587 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  36.45 
 
 
470 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.615494  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1788  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  36.45 
 
 
470 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.71 
 
 
918 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1394  nitrogenase iron-iron protein, alpha chain  36.96 
 
 
519 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4683  nitrogenase alpha chain  36.46 
 
 
524 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2077  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.69 
 
 
918 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  33.11 
 
 
459 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4139  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  36.69 
 
 
936 aa  279  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3206  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.78 
 
 
918 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2278  nitrogenase, subunit alpha  37.44 
 
 
465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000740744  normal  0.119504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3932  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  35.96 
 
 
480 aa  273  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.844513  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02610  vanadium nitrogenase, alpha subunit, vnfD  35.43 
 
 
474 aa  272  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1622  nitrogenase alpha chain  36.38 
 
 
522 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  32.8 
 
 
915 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1052  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  36.21 
 
 
452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2611  nitrogenase alpha chain  35.62 
 
 
523 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.718725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  33.79 
 
 
917 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2117  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  35.12 
 
 
467 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0140649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>