More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1952 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  61.76 
 
 
539 aa  719    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1630  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  77.94 
 
 
542 aa  913    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000671543  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1531  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  88.21 
 
 
546 aa  1012    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  87.27 
 
 
544 aa  1006    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0023858  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0682  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  90.29 
 
 
546 aa  1035    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  78.74 
 
 
540 aa  895    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  67.66 
 
 
544 aa  801    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  66.79 
 
 
551 aa  786    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  66.54 
 
 
546 aa  790    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0741  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  88.83 
 
 
546 aa  1016    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  57.53 
 
 
542 aa  638    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1952  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  100 
 
 
544 aa  1129    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0543638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  53.76 
 
 
545 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  54.16 
 
 
539 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  51.62 
 
 
541 aa  588  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  51.05 
 
 
546 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0168  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  48.74 
 
 
533 aa  541  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488812  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1050  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40 
 
 
477 aa  422  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1011  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  41.87 
 
 
487 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.77042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3468  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  41.97 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0663  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  41.59 
 
 
481 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.508011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3029  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.81 
 
 
483 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0649  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  41.67 
 
 
481 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.997162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2075  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  41.67 
 
 
487 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4487  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  41.46 
 
 
486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493572  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2144  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  42.25 
 
 
480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2820  nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha chain  41.17 
 
 
479 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6224  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.91 
 
 
500 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3204  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.23 
 
 
483 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6880  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  41.33 
 
 
486 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2119  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.49 
 
 
476 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0308502 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.42 
 
 
487 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0089  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.91 
 
 
501 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1176  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.58 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2099  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.65 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2344  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.69 
 
 
487 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0441193  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2191  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.94 
 
 
493 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395448  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0540  nitrogenase iron-molybdenum protein, alpha chain  40.94 
 
 
493 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.94 
 
 
493 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.867808 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1239  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.05 
 
 
491 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1569  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.45 
 
 
499 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.825856  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1521  nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha subunit  39.05 
 
 
491 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0230  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.5 
 
 
486 aa  395  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.403364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1431  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.54 
 
 
485 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5053  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.96 
 
 
509 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01390  Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain:Nitrogenase component I, alpha chain  39.21 
 
 
492 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1201  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.54 
 
 
479 aa  395  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75707  hitchhiker  0.00777378 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1814  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.16 
 
 
476 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5100  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.59 
 
 
487 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4931  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.4 
 
 
503 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0970  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.81 
 
 
487 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659095  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1786  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.16 
 
 
476 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4462  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.39 
 
 
503 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1466  nitrogenase, molybdenum-iron protein alpha chain(NifD)  39.12 
 
 
487 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00189861  hitchhiker  0.000541069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1074  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.81 
 
 
487 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811234  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2365  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.36 
 
 
494 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0474  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.73 
 
 
486 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387575  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3631  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.73 
 
 
488 aa  385  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.486898 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0273  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.11 
 
 
488 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4248  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.53 
 
 
491 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1353  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit alpha  38.29 
 
 
500 aa  381  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4137  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.59 
 
 
485 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.303688  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1414  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain:nitrogenase component I, alpha chain  38.2 
 
 
490 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0492  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.24 
 
 
482 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5924  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain, nifD  36.14 
 
 
500 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3535  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.07 
 
 
505 aa  334  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330335  normal  0.0313062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3917  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.25 
 
 
480 aa  334  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  37.55 
 
 
476 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3995  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  35.27 
 
 
505 aa  325  9e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  34.99 
 
 
476 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1798  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  32.88 
 
 
480 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0103  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  33.07 
 
 
480 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.21101  normal  0.23619 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0663  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  33.07 
 
 
478 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1431  nitrogenase component I, alpha chain  33.79 
 
 
475 aa  296  5e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0062  nitrogenase alpha chain  34.2 
 
 
475 aa  295  1e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  33.01 
 
 
476 aa  293  6e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0101  nitrogenase alpha chain  33.94 
 
 
476 aa  290  6e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299285  normal  0.0821221 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1800  nitrogenase alpha chain  33.27 
 
 
477 aa  290  6e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.515019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0551  nitrogenase component I, alpha chain  35.71 
 
 
486 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.39708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4026  nitrogenase vanadium-iron protein, alpha chain  32.85 
 
 
587 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2278  nitrogenase, subunit alpha  34.38 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000740744  normal  0.119504 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  35.38 
 
 
482 aa  283  8.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0661  nitrogenase alpha chain  33.27 
 
 
476 aa  279  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.949804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02610  vanadium nitrogenase, alpha subunit, vnfD  32.67 
 
 
474 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4683  nitrogenase alpha chain  32.71 
 
 
524 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1394  nitrogenase iron-iron protein, alpha chain  32.5 
 
 
519 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  31.42 
 
 
518 aa  259  6e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2611  nitrogenase alpha chain  31.95 
 
 
523 aa  257  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.718725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1553  nitrogenase, subunit D  30.96 
 
 
530 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1622  nitrogenase alpha chain  32.5 
 
 
522 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48990  nitrogenase iron-iron protein, alpha chain  31.82 
 
 
518 aa  250  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.546352  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1153  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.57 
 
 
454 aa  243  5e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0447596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0841  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.6 
 
 
462 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1249  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.93 
 
 
453 aa  239  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.265854  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.13 
 
 
462 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.57 
 
 
448 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1954  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.19 
 
 
453 aa  237  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.396368  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1756  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.34 
 
 
453 aa  237  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00502819  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  29.07 
 
 
917 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.23 
 
 
465 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>