More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2616 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  63.62 
 
 
539 aa  746    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1952  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  67.66 
 
 
544 aa  801    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0543638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  78.01 
 
 
546 aa  893    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1531  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  69.57 
 
 
546 aa  809    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1630  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  71.27 
 
 
542 aa  828    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000671543  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  67.41 
 
 
544 aa  786    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0023858  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  69.5 
 
 
540 aa  812    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0682  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  67.96 
 
 
546 aa  804    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  100 
 
 
544 aa  1134    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  73.64 
 
 
551 aa  854    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0741  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  67.23 
 
 
546 aa  796    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  57.74 
 
 
542 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  55.13 
 
 
539 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  55.13 
 
 
545 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  52.26 
 
 
541 aa  598  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  50.95 
 
 
546 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0168  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  47.98 
 
 
533 aa  527  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488812  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3029  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.46 
 
 
483 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3468  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.66 
 
 
481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1050  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.61 
 
 
477 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0663  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.38 
 
 
481 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.508011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0649  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.54 
 
 
481 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.997162  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4487  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.01 
 
 
486 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493572  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1176  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.7 
 
 
479 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5924  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain, nifD  38.9 
 
 
500 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2344  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.24 
 
 
487 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0441193  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1569  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.62 
 
 
499 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.825856  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1011  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  39.92 
 
 
487 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.77042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2820  nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha chain  38.31 
 
 
479 aa  389  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6224  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.33 
 
 
500 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2099  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.27 
 
 
486 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0089  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.4 
 
 
501 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2119  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.23 
 
 
476 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0308502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1431  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.93 
 
 
485 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3204  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.03 
 
 
483 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2075  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.34 
 
 
487 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4137  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.3 
 
 
485 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.303688  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2144  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.65 
 
 
480 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683896 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4931  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.38 
 
 
503 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0230  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.1 
 
 
486 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.403364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6880  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.67 
 
 
486 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1353  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit alpha  37.64 
 
 
500 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1786  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.36 
 
 
476 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1814  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.36 
 
 
476 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1521  nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha subunit  38.05 
 
 
491 aa  379  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5053  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.31 
 
 
509 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2365  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.7 
 
 
494 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3631  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.43 
 
 
488 aa  379  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.486898 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1239  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.05 
 
 
491 aa  379  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291496 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.92 
 
 
493 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.867808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1466  nitrogenase, molybdenum-iron protein alpha chain(NifD)  38.02 
 
 
487 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00189861  hitchhiker  0.000541069 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0540  nitrogenase iron-molybdenum protein, alpha chain  37.43 
 
 
493 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5100  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38 
 
 
487 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0970  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.71 
 
 
487 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659095  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2191  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.43 
 
 
493 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395448  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4462  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.12 
 
 
503 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0474  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.24 
 
 
486 aa  375  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387575  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1074  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.71 
 
 
487 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811234  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1201  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.69 
 
 
479 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75707  hitchhiker  0.00777378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01390  Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain:Nitrogenase component I, alpha chain  37.31 
 
 
492 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4248  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.76 
 
 
491 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0492  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.19 
 
 
482 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0273  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.17 
 
 
488 aa  364  3e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3917  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.12 
 
 
480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1414  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain:nitrogenase component I, alpha chain  36.15 
 
 
490 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.95 
 
 
487 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3535  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  42.16 
 
 
505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330335  normal  0.0313062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  37.34 
 
 
476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3995  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  33.76 
 
 
505 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  35.67 
 
 
482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  36.78 
 
 
476 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0551  nitrogenase component I, alpha chain  36.13 
 
 
486 aa  301  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.39708  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0062  nitrogenase alpha chain  34.34 
 
 
475 aa  295  1e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1800  nitrogenase alpha chain  33.98 
 
 
477 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.515019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0661  nitrogenase alpha chain  33.46 
 
 
476 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.949804  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0101  nitrogenase alpha chain  33.46 
 
 
476 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299285  normal  0.0821221 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1431  nitrogenase component I, alpha chain  32.36 
 
 
475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0663  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  32.39 
 
 
478 aa  281  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4026  nitrogenase vanadium-iron protein, alpha chain  32.84 
 
 
587 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1798  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  31.59 
 
 
480 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  31.95 
 
 
476 aa  277  4e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0103  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  31.99 
 
 
480 aa  276  6e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.21101  normal  0.23619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02610  vanadium nitrogenase, alpha subunit, vnfD  33.4 
 
 
474 aa  264  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1153  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.6 
 
 
454 aa  258  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0447596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2278  nitrogenase, subunit alpha  33.13 
 
 
465 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000740744  normal  0.119504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  30.31 
 
 
518 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1954  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.78 
 
 
453 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.396368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48990  nitrogenase iron-iron protein, alpha chain  33.2 
 
 
518 aa  254  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.546352  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1249  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.74 
 
 
453 aa  252  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.265854  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1632  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.53 
 
 
453 aa  252  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00463409  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2611  nitrogenase alpha chain  33.54 
 
 
523 aa  252  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.718725  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1394  nitrogenase iron-iron protein, alpha chain  32.91 
 
 
519 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1622  nitrogenase alpha chain  32.66 
 
 
522 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2620  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  31.6 
 
 
474 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4683  nitrogenase alpha chain  31.92 
 
 
524 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1756  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.51 
 
 
453 aa  246  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00502819  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  30.71 
 
 
919 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  29.74 
 
 
919 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1553  nitrogenase, subunit D  30.88 
 
 
530 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1533  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.58 
 
 
453 aa  242  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.936667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>