More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0404 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  100 
 
 
731 aa  1498    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  39.53 
 
 
746 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  39.11 
 
 
728 aa  501  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  51.7 
 
 
280 aa  254  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  50.94 
 
 
272 aa  248  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  53.28 
 
 
270 aa  246  9e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0408  nitrogenase  50 
 
 
254 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  51.41 
 
 
268 aa  236  8e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.54 
 
 
284 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  44.94 
 
 
276 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  52.02 
 
 
251 aa  233  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  50 
 
 
248 aa  228  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  46.62 
 
 
273 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  46.82 
 
 
275 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  50.81 
 
 
272 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  44.37 
 
 
324 aa  227  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  46.82 
 
 
272 aa  227  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  43.88 
 
 
296 aa  224  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  43.7 
 
 
278 aa  223  8e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  45.86 
 
 
273 aa  223  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  44.91 
 
 
288 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  45.76 
 
 
275 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  45.72 
 
 
274 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  44.74 
 
 
273 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  47.01 
 
 
276 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  44.09 
 
 
290 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  45.72 
 
 
275 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  45.79 
 
 
276 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  43.53 
 
 
289 aa  221  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  44.24 
 
 
287 aa  220  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  45.49 
 
 
283 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.56 
 
 
296 aa  220  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  48.39 
 
 
274 aa  219  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  46.67 
 
 
277 aa  219  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  46.86 
 
 
299 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1538  Nitrogenase  46.91 
 
 
259 aa  219  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925068  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  45.86 
 
 
276 aa  219  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  47.04 
 
 
274 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  49.79 
 
 
290 aa  219  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  42.65 
 
 
291 aa  219  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  46.72 
 
 
292 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  45.25 
 
 
264 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0347  nitrogenase iron protein subunit NifH  42.59 
 
 
265 aa  218  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  45.67 
 
 
290 aa  218  4e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  47.1 
 
 
292 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  47.93 
 
 
303 aa  217  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  47.93 
 
 
293 aa  217  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  45.02 
 
 
280 aa  216  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  42.28 
 
 
299 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  44.15 
 
 
275 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  47.77 
 
 
290 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  45.45 
 
 
290 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  45.52 
 
 
295 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  50 
 
 
288 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  44.89 
 
 
276 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  43.21 
 
 
288 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  43.16 
 
 
292 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  43.73 
 
 
298 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  43.88 
 
 
298 aa  214  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  49.12 
 
 
289 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  46.75 
 
 
289 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  43.4 
 
 
275 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  50.43 
 
 
297 aa  213  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  46.34 
 
 
288 aa  213  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  48.98 
 
 
299 aa  213  7e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  44.78 
 
 
275 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7753  nitrogenase reductase  42.16 
 
 
293 aa  213  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  43.77 
 
 
275 aa  213  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  45.35 
 
 
274 aa  213  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  46.69 
 
 
290 aa  213  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  43.73 
 
 
295 aa  213  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  48.76 
 
 
326 aa  213  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  42.51 
 
 
293 aa  212  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7808  nitrogenase reductase  42.16 
 
 
293 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220892  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  46.72 
 
 
313 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  44 
 
 
299 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  43.88 
 
 
299 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  43.17 
 
 
275 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  44.03 
 
 
264 aa  212  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  44 
 
 
299 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  47.04 
 
 
274 aa  212  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  44.03 
 
 
296 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  44.03 
 
 
296 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  43.17 
 
 
299 aa  211  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.12 
 
 
289 aa  211  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  44 
 
 
300 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  43.54 
 
 
275 aa  211  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  46.75 
 
 
289 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  47.58 
 
 
274 aa  211  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.35 
 
 
324 aa  210  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  43.45 
 
 
275 aa  210  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  45.56 
 
 
292 aa  210  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6225  nitrogenase reductase  43.17 
 
 
297 aa  210  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  43.02 
 
 
275 aa  210  7e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  43.17 
 
 
295 aa  210  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2345  nitrogenase reductase  45.71 
 
 
296 aa  210  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.383855  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  47.58 
 
 
274 aa  210  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  47.84 
 
 
289 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  45.75 
 
 
295 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  44.57 
 
 
296 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>