101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2034 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  98.17 
 
 
491 aa  986    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  66.95 
 
 
480 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  67.92 
 
 
483 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  81.61 
 
 
494 aa  822    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  68.81 
 
 
482 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  68.19 
 
 
483 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  97.96 
 
 
491 aa  985    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  100 
 
 
491 aa  1002    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  68.75 
 
 
483 aa  688    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  83.95 
 
 
488 aa  838    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  71.09 
 
 
488 aa  666    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  70.04 
 
 
488 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  68.61 
 
 
487 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  70.83 
 
 
488 aa  658    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  69.38 
 
 
482 aa  679    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  65.77 
 
 
485 aa  640    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  70.87 
 
 
488 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  62.89 
 
 
509 aa  632  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  39.4 
 
 
493 aa  342  8e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  39.8 
 
 
493 aa  340  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  39.87 
 
 
468 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  36.89 
 
 
469 aa  329  9e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  38.48 
 
 
469 aa  327  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  38.27 
 
 
469 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  37.65 
 
 
469 aa  322  9.000000000000001e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  40.12 
 
 
493 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1716  chlorophyllide reductase subunit Z  38.68 
 
 
468 aa  318  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0124  chlorophyllide reductase subunit Z  37.11 
 
 
469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.957131  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.98 
 
 
531 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.77 
 
 
531 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.5 
 
 
546 aa  89.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.9 
 
 
532 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.08 
 
 
506 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.21 
 
 
508 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.19 
 
 
508 aa  83.6  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.36 
 
 
508 aa  83.2  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.14 
 
 
531 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.7 
 
 
530 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.04 
 
 
508 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.94 
 
 
541 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.24 
 
 
563 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.11 
 
 
508 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.76 
 
 
544 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.67 
 
 
526 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.19 
 
 
540 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.68 
 
 
508 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.32 
 
 
530 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.68 
 
 
507 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.1 
 
 
535 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.25 
 
 
541 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.5 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.04 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.46 
 
 
535 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.56 
 
 
508 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.02 
 
 
526 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.08 
 
 
517 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.03 
 
 
568 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  33.12 
 
 
459 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.56 
 
 
525 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.8 
 
 
535 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.52 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27 
 
 
508 aa  70.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.98 
 
 
532 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  25.07 
 
 
466 aa  70.1  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  24.08 
 
 
460 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.27 
 
 
536 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.61 
 
 
523 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.78 
 
 
519 aa  67.4  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.36 
 
 
535 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.64 
 
 
525 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.57 
 
 
534 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.82 
 
 
523 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.57 
 
 
534 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  25.52 
 
 
444 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  23.81 
 
 
402 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  26.42 
 
 
431 aa  63.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.45 
 
 
522 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.36 
 
 
533 aa  61.6  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.67 
 
 
425 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.09 
 
 
509 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  24.81 
 
 
446 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.04 
 
 
540 aa  57  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  28.66 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.43 
 
 
480 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.72 
 
 
347 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  23.64 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  28.57 
 
 
348 aa  53.5  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  22.83 
 
 
509 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  27.17 
 
 
463 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  26.02 
 
 
339 aa  50.1  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.6 
 
 
528 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1566  nitrogenase  24.32 
 
 
447 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1998  nitrogenase  24.03 
 
 
512 aa  49.3  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.82 
 
 
466 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.79 
 
 
541 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.38 
 
 
355 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.66 
 
 
476 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.06 
 
 
546 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  27.08 
 
 
450 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  31.9 
 
 
448 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>