290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1009 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.92 
 
 		 530 aa  704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.36 
 
 		 525 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  65.29 
 
 		 517 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  65.39 
 
 		 540 aa  722    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.23 
 
 		 532 aa  697    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.88 
 
 		 528 aa  840    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.58 
 
 		 506 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  87.06 
 
 		 534 aa  974    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  87.06 
 
 		 534 aa  974    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.6 
 
 		 531 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.89 
 
 		 541 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 		 522 aa  1075    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  65.16 
 
 		 546 aa  710    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  65.23 
 
 		 508 aa  696    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.85 
 
 		 531 aa  711    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  67.96 
 
 		 541 aa  723    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  73.8 
 
 		 519 aa  811    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  67.04 
 
 		 530 aa  730    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  67.91 
 
 		 535 aa  728    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.93 
 
 		 525 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.85 
 
 		 531 aa  714    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.86 
 
 		 526 aa  658    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.7 
 
 		 524 aa  624  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.66 
 
 		 536 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.4 
 
 		 526 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.96 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.17 
 
 		 523 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.22 
 
 		 523 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.25 
 
 		 507 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.18 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.81 
 
 		 508 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.76 
 
 		 508 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.25 
 
 		 533 aa  318  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.99 
 
 		 563 aa  317  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.62 
 
 		 535 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.2 
 
 		 508 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.2 
 
 		 535 aa  309  9e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.22 
 
 		 544 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.62 
 
 		 568 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.62 
 
 		 508 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.83 
 
 		 508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.83 
 
 		 508 aa  303  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.89 
 
 		 535 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.83 
 
 		 540 aa  300  4e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.9 
 
 		 532 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.09 
 
 		 525 aa  289  8e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.36 
 
 		 480 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  21.08 
 
 		 402 aa  91.7  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.69 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  23.8 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  25.65 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  25.65 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  25.65 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  25.2 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.02 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  25 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  21.73 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  27.24 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  25.59 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  25.94 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  21.97 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  27.53 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.88 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.88 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.69 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  23.54 
 
 		 493 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  24.4 
 
 		 458 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  24.3 
 
 		 493 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.7 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  27.43 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  25.59 
 
 		 488 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  24.11 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  25.65 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  30.68 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.85 
 
 		 513 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  26.42 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  22.78 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  24.17 
 
 		 450 aa  72  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  22.99 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  21.89 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.61 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.78 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  23.82 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.17 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  25.71 
 
 		 487 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  22.44 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  22.1 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  23.33 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  26.84 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.72 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  26.01 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.11 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  28.65 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  25.17 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  27.97 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  25.42 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.48 
 
 		 347 aa  67  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.06 
 
 		 458 aa  67  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25 
 
 		 348 aa  67  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>