279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1955 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  82.71 
 
 
451 aa  777    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  76.1 
 
 
456 aa  740    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  75.88 
 
 
457 aa  735    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  79.56 
 
 
450 aa  748    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  83.07 
 
 
452 aa  801    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  100 
 
 
450 aa  931    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  84.22 
 
 
450 aa  794    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  53.35 
 
 
454 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  53.15 
 
 
451 aa  487  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  49.67 
 
 
450 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  49.68 
 
 
538 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  44.99 
 
 
477 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  40.36 
 
 
466 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  39.36 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  39.13 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  38.3 
 
 
479 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1148  nitrogenase  39.91 
 
 
463 aa  323  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.134067  normal  0.680511 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  38.9 
 
 
458 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  38.67 
 
 
458 aa  322  6e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  38.67 
 
 
458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.64 
 
 
458 aa  295  8e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.14 
 
 
458 aa  294  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  37.07 
 
 
475 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.81 
 
 
461 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.34 
 
 
461 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.1 
 
 
463 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.24 
 
 
455 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  37.73 
 
 
456 aa  286  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.82 
 
 
458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.52 
 
 
459 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.24 
 
 
455 aa  280  3e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.56 
 
 
460 aa  280  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  35.47 
 
 
475 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.97 
 
 
459 aa  275  9e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  36.24 
 
 
461 aa  273  6e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  35.41 
 
 
462 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  35.41 
 
 
462 aa  272  9e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  35.78 
 
 
462 aa  272  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.04 
 
 
459 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  34.74 
 
 
462 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.54 
 
 
460 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.83 
 
 
460 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.33 
 
 
485 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  34.45 
 
 
490 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.01 
 
 
511 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3097  nitrogenase  44.29 
 
 
512 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.92 
 
 
487 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  35.84 
 
 
472 aa  256  6e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.09 
 
 
512 aa  253  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  36.02 
 
 
918 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  34.62 
 
 
461 aa  249  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4251  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.85 
 
 
905 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2077  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  35.12 
 
 
918 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.44 
 
 
522 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.18 
 
 
518 aa  244  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  35.98 
 
 
917 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.31 
 
 
472 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.06 
 
 
518 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.97 
 
 
524 aa  241  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.03 
 
 
489 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.63 
 
 
523 aa  240  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3491  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.9 
 
 
919 aa  240  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.32 
 
 
489 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  35.49 
 
 
915 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.26 
 
 
489 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  34.46 
 
 
511 aa  236  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  33.26 
 
 
489 aa  235  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.95 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.29 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.23 
 
 
523 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.56 
 
 
512 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  34.44 
 
 
463 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  33.62 
 
 
462 aa  232  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.33 
 
 
487 aa  232  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4797  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.28 
 
 
443 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.87 
 
 
487 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.2 
 
 
489 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.33 
 
 
511 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.33 
 
 
487 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2324  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  33.94 
 
 
471 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.122989  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3027  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  35.8 
 
 
917 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  35.02 
 
 
919 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.37 
 
 
522 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.25 
 
 
919 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.78 
 
 
511 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.78 
 
 
511 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.3 
 
 
519 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1349  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  31.89 
 
 
443 aa  226  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  32.1 
 
 
462 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.8 
 
 
510 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7730  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  33.49 
 
 
449 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02590  vanadium nitrogenase beta subunit, vnfK  32.74 
 
 
475 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.14 
 
 
506 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.14 
 
 
516 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.71 
 
 
506 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.6 
 
 
519 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3933  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.12 
 
 
444 aa  222  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0348274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.26 
 
 
520 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.86 
 
 
519 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  33.11 
 
 
519 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>