263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1012 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  100 
 
 
454 aa  923    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  57.02 
 
 
538 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  51.64 
 
 
457 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  53.35 
 
 
450 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  51.77 
 
 
456 aa  495  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  54.75 
 
 
450 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  54.24 
 
 
450 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  53.23 
 
 
451 aa  490  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  51.57 
 
 
452 aa  486  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  51.34 
 
 
450 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  49.67 
 
 
451 aa  427  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  44.32 
 
 
477 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  41.97 
 
 
466 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  42.2 
 
 
456 aa  343  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  41.06 
 
 
479 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1148  nitrogenase  43.19 
 
 
463 aa  331  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.134067  normal  0.680511 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  37.35 
 
 
458 aa  325  1e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3097  nitrogenase  56.99 
 
 
512 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  36.66 
 
 
458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  37.12 
 
 
458 aa  307  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  37.12 
 
 
458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  37.7 
 
 
475 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  37.01 
 
 
475 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  36.43 
 
 
456 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.36 
 
 
461 aa  273  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  33.63 
 
 
462 aa  269  7e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  34.86 
 
 
461 aa  268  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.36 
 
 
455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  33.63 
 
 
462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  35.36 
 
 
490 aa  266  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  33.86 
 
 
462 aa  266  5e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  32.96 
 
 
462 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.63 
 
 
458 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.86 
 
 
458 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.18 
 
 
458 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.78 
 
 
455 aa  259  8e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.23 
 
 
461 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.26 
 
 
459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.58 
 
 
460 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.15 
 
 
487 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.13 
 
 
460 aa  250  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34 
 
 
518 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.07 
 
 
460 aa  247  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  33.26 
 
 
461 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.35 
 
 
463 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.31 
 
 
459 aa  247  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  33.41 
 
 
472 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.07 
 
 
518 aa  244  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.85 
 
 
511 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.05 
 
 
485 aa  243  6e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.05 
 
 
524 aa  242  9e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.16 
 
 
489 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.78 
 
 
511 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.78 
 
 
511 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.9 
 
 
489 aa  239  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  33.85 
 
 
489 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.19 
 
 
459 aa  236  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.71 
 
 
489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.23 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.14 
 
 
523 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  32.81 
 
 
463 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.78 
 
 
489 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.08 
 
 
487 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2189  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  32.96 
 
 
943 aa  232  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.235442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.38 
 
 
472 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.74 
 
 
511 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0537  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.74 
 
 
455 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.09 
 
 
523 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.74 
 
 
512 aa  231  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.23 
 
 
487 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.03 
 
 
512 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.11 
 
 
487 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  32.13 
 
 
462 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1250  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.74 
 
 
455 aa  226  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  31.53 
 
 
462 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1077  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  33.11 
 
 
458 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.4 
 
 
917 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  31.51 
 
 
511 aa  221  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0973  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  33.26 
 
 
458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.45 
 
 
512 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02590  vanadium nitrogenase beta subunit, vnfK  31.51 
 
 
475 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0477  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  32.07 
 
 
459 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.69 
 
 
519 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4459  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.28 
 
 
457 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31 
 
 
516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.56 
 
 
522 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31 
 
 
506 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1566  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  30.07 
 
 
465 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.82 
 
 
512 aa  216  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4797  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.12 
 
 
443 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3491  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  33.71 
 
 
919 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  31.39 
 
 
462 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4251  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  31.83 
 
 
905 aa  216  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1349  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  31.07 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  32.13 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3538  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  33.26 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  30.43 
 
 
461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3206  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  35.15 
 
 
918 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.33 
 
 
520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  31 
 
 
519 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>