259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3097 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008741  Dvul_3097  nitrogenase  100 
 
 
512 aa  1023    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  50.59 
 
 
454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  41.65 
 
 
452 aa  392  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  39.69 
 
 
456 aa  365  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  39.1 
 
 
457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  39.64 
 
 
451 aa  355  6.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  58.77 
 
 
538 aa  349  7e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  36.67 
 
 
477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1148  nitrogenase  36.51 
 
 
463 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.134067  normal  0.680511 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  36.7 
 
 
450 aa  294  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  50.52 
 
 
450 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  34.17 
 
 
451 aa  277  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  35.07 
 
 
456 aa  277  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  33.08 
 
 
450 aa  272  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.32 
 
 
461 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  33.2 
 
 
450 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  33.81 
 
 
475 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  27.71 
 
 
458 aa  246  6e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2285  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  34.48 
 
 
465 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.04 
 
 
458 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0234  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  30.95 
 
 
457 aa  230  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0346519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0477  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  31.14 
 
 
459 aa  230  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.72 
 
 
461 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  33.74 
 
 
919 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  27.31 
 
 
458 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.8 
 
 
511 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.42 
 
 
523 aa  226  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  27.71 
 
 
458 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.34 
 
 
518 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  30.6 
 
 
490 aa  225  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.88 
 
 
458 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.18 
 
 
520 aa  221  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.2 
 
 
518 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.61 
 
 
455 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.94 
 
 
511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.94 
 
 
511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.54 
 
 
519 aa  220  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  29.54 
 
 
519 aa  220  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  29.64 
 
 
511 aa  219  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.8 
 
 
512 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.94 
 
 
524 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.86 
 
 
511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  29.82 
 
 
519 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.6 
 
 
519 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1566  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  31.76 
 
 
465 aa  216  9e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5921  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  29.72 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3491  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  31.82 
 
 
919 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0973  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.25 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  29.84 
 
 
472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.28 
 
 
512 aa  213  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  30.58 
 
 
475 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  30.97 
 
 
918 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  29.38 
 
 
489 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.41 
 
 
487 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.49 
 
 
487 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.52 
 
 
519 aa  211  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.43 
 
 
512 aa  211  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.66 
 
 
519 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3027  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  32.93 
 
 
917 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2077  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  31.24 
 
 
918 aa  210  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1075  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.8 
 
 
537 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.902597  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.77 
 
 
519 aa  209  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.55 
 
 
487 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.57 
 
 
489 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.66 
 
 
519 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  26.24 
 
 
458 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.8 
 
 
487 aa  207  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1053  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  31.08 
 
 
432 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  31.43 
 
 
915 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.98 
 
 
522 aa  206  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  29.96 
 
 
461 aa  205  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.96 
 
 
459 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.55 
 
 
489 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.86 
 
 
513 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.44 
 
 
460 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.07 
 
 
460 aa  204  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.97 
 
 
487 aa  204  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.63 
 
 
506 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4797  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  29.72 
 
 
443 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.16 
 
 
485 aa  201  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.16 
 
 
519 aa  200  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3933  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  26.89 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0348274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1467  nitrogenase, molybdenum-iron protein beta chain(NifK)  27.93 
 
 
519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  hitchhiker  0.00055229 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  38.97 
 
 
479 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1349  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  27 
 
 
443 aa  196  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.46 
 
 
513 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.19 
 
 
518 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1817  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  28.88 
 
 
461 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.5 
 
 
506 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3538  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  30.2 
 
 
460 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1789  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  28.88 
 
 
461 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.5 
 
 
516 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.6 
 
 
489 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.29 
 
 
463 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5097  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  30.43 
 
 
457 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2116  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  29.67 
 
 
450 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00896197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3992  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  31.5 
 
 
460 aa  193  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  26.09 
 
 
462 aa  193  8e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.57 
 
 
459 aa  193  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.24 
 
 
459 aa  192  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>