285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2621 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  100 
 
 
538 aa  1081    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  59.57 
 
 
450 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  57.02 
 
 
454 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  49.68 
 
 
450 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  46.91 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  47.87 
 
 
456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  50.75 
 
 
450 aa  444  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  47.95 
 
 
452 aa  438  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  47.74 
 
 
451 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  46.77 
 
 
450 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  46.65 
 
 
451 aa  414  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  41.85 
 
 
477 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  39.47 
 
 
479 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3097  nitrogenase  58.77 
 
 
512 aa  349  9e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  39.47 
 
 
456 aa  332  8e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  37.17 
 
 
466 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  35.04 
 
 
458 aa  320  6e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  35.94 
 
 
458 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  35.49 
 
 
458 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  37.03 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  35.27 
 
 
458 aa  307  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  36.32 
 
 
475 aa  298  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1148  nitrogenase  38.22 
 
 
463 aa  297  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.134067  normal  0.680511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  35.65 
 
 
456 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.51 
 
 
461 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  33.89 
 
 
490 aa  274  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.05 
 
 
455 aa  270  5e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  32.12 
 
 
462 aa  266  5e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  32.33 
 
 
462 aa  266  7e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.26 
 
 
455 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.76 
 
 
458 aa  265  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.97 
 
 
461 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  31.69 
 
 
462 aa  264  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.55 
 
 
458 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.56 
 
 
511 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  32.47 
 
 
462 aa  263  8e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.82 
 
 
511 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.76 
 
 
458 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.35 
 
 
459 aa  258  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  35.58 
 
 
917 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.08 
 
 
463 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.81 
 
 
511 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  32.98 
 
 
461 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.43 
 
 
512 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.81 
 
 
511 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.89 
 
 
460 aa  252  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.89 
 
 
460 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.22 
 
 
459 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0477  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  33.19 
 
 
459 aa  249  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.52 
 
 
460 aa  249  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3206  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  36.68 
 
 
918 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.01 
 
 
459 aa  247  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.99 
 
 
918 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.87 
 
 
919 aa  247  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2077  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.99 
 
 
918 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3491  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.29 
 
 
919 aa  246  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.37 
 
 
524 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0234  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  33.69 
 
 
457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0346519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.89 
 
 
487 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3628  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  31 
 
 
464 aa  243  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.350687 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.41 
 
 
485 aa  243  6e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  35 
 
 
915 aa  243  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  34.77 
 
 
919 aa  243  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.36 
 
 
487 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  34.63 
 
 
463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.09 
 
 
523 aa  240  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.19 
 
 
518 aa  240  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.21 
 
 
487 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2324  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.75 
 
 
471 aa  239  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.122989  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3027  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  36.24 
 
 
917 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  32.55 
 
 
511 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.77 
 
 
489 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  32.83 
 
 
462 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.26 
 
 
518 aa  238  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.4 
 
 
489 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.33 
 
 
489 aa  236  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  34.14 
 
 
489 aa  236  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  31.24 
 
 
461 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.49 
 
 
512 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.48 
 
 
512 aa  235  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.9 
 
 
472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.26 
 
 
487 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.5 
 
 
522 aa  233  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.22 
 
 
489 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1566  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.05 
 
 
465 aa  233  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5921  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  30.28 
 
 
464 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2285  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.97 
 
 
465 aa  232  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4459  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  31.57 
 
 
457 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.94 
 
 
523 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  32.98 
 
 
472 aa  230  5e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  31.13 
 
 
461 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1349  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  30.94 
 
 
443 aa  229  8e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  31.02 
 
 
519 aa  229  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1350  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  31.89 
 
 
457 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2189  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  31.61 
 
 
943 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.235442 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.59 
 
 
487 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  31.67 
 
 
462 aa  228  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4797  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  31.89 
 
 
443 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1234  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  30.8 
 
 
453 aa  227  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1516  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  30.8 
 
 
453 aa  227  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>