More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2276 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  65.8 
 
 		 462 aa  668    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  100 
 
 		 461 aa  947    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  73.28 
 
 		 463 aa  698    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  64.29 
 
 		 462 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  61.9 
 
 		 462 aa  644    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  59.74 
 
 		 462 aa  627  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  61.47 
 
 		 461 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02590  vanadium nitrogenase beta subunit, vnfK  63.2 
 
 		 475 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  59.09 
 
 		 462 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  42.51 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  41.54 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  41.54 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  40.88 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  40.04 
 
 		 456 aa  342  8e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  39.73 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  42.58 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  39.19 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  39.19 
 
 		 458 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  38.44 
 
 		 475 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  38.43 
 
 		 458 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  37.78 
 
 		 475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  38.95 
 
 		 477 aa  310  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  37.41 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.33 
 
 		 458 aa  289  7e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.87 
 
 		 511 aa  289  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.87 
 
 		 511 aa  289  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.81 
 
 		 487 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.08 
 
 		 455 aa  286  5e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.73 
 
 		 511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.5 
 
 		 487 aa  280  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.87 
 
 		 463 aa  279  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.54 
 
 		 487 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.32 
 
 		 489 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.63 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.67 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.15 
 
 		 459 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.4 
 
 		 459 aa  276  7e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.05 
 
 		 487 aa  275  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.28 
 
 		 512 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.84 
 
 		 461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  35.12 
 
 		 461 aa  273  6e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.81 
 
 		 511 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.59 
 
 		 487 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.26 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.54 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.47 
 
 		 512 aa  270  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.27 
 
 		 485 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  34.54 
 
 		 489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.28 
 
 		 512 aa  267  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.66 
 
 		 459 aa  266  5e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.7 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  35.73 
 
 		 511 aa  263  6e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.6 
 
 		 460 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.47 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.2 
 
 		 460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.65 
 
 		 489 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.04 
 
 		 518 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1075  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.76 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.902597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  35.63 
 
 		 519 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  31.97 
 
 		 479 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.02 
 
 		 518 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.33 
 
 		 458 aa  255  9e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.76 
 
 		 519 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.24 
 
 		 519 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  32.81 
 
 		 451 aa  250  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  32.88 
 
 		 466 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.61 
 
 		 524 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  34.44 
 
 		 456 aa  249  6e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  34.62 
 
 		 450 aa  249  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  33.71 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  33.26 
 
 		 454 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.7 
 
 		 519 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.59 
 
 		 519 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  34.83 
 
 		 452 aa  246  8e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.07 
 
 		 520 aa  246  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.85 
 
 		 522 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.4 
 
 		 523 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  35.54 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.22 
 
 		 518 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  34.8 
 
 		 519 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.8 
 
 		 519 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.66 
 
 		 519 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.54 
 
 		 513 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.47 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.19 
 
 		 523 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1432  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.67 
 
 		 519 aa  240  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.68 
 
 		 516 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.25 
 
 		 519 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.68 
 
 		 506 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.04 
 
 		 522 aa  239  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.63 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.81 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1426  nitrogenase  36.07 
 
 		 418 aa  237  4e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.29 
 
 		 512 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.45 
 
 		 506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  31.45 
 
 		 538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  34.38 
 
 		 450 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.85 
 
 		 519 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1467  nitrogenase, molybdenum-iron protein beta chain(NifK)  33.19 
 
 		 519 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  hitchhiker  0.00055229 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.6 
 
 		 519 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>