94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3519 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  69.12 
 
 		 480 aa  679    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  83.74 
 
 		 491 aa  839    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  83.95 
 
 		 491 aa  838    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  72.61 
 
 		 483 aa  724    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  66.27 
 
 		 509 aa  665    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  100 
 
 		 488 aa  1004    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  73.7 
 
 		 488 aa  702    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  71.16 
 
 		 483 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  73.53 
 
 		 482 aa  735    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  87.84 
 
 		 494 aa  891    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  74.25 
 
 		 488 aa  697    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  71.64 
 
 		 483 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  71.79 
 
 		 487 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  73.9 
 
 		 488 aa  694    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  71.58 
 
 		 482 aa  717    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  73.48 
 
 		 488 aa  700    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  83.95 
 
 		 491 aa  840    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  69.87 
 
 		 485 aa  685    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  38.49 
 
 		 493 aa  345  8.999999999999999e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  38.99 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  39.46 
 
 		 468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  34.98 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  38.16 
 
 		 469 aa  334  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  38.14 
 
 		 469 aa  333  5e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  37.11 
 
 		 469 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1716  chlorophyllide reductase subunit Z  38.07 
 
 		 468 aa  329  6e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0124  chlorophyllide reductase subunit Z  37.32 
 
 		 469 aa  325  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.957131  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  40.2 
 
 		 493 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.69 
 
 		 531 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.29 
 
 		 531 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.6 
 
 		 532 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.9 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.21 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.13 
 
 		 531 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.95 
 
 		 525 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.32 
 
 		 506 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.05 
 
 		 525 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.27 
 
 		 540 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.95 
 
 		 508 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.94 
 
 		 526 aa  91.3  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.83 
 
 		 541 aa  90.9  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.38 
 
 		 535 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.43 
 
 		 541 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.94 
 
 		 546 aa  88.2  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.26 
 
 		 517 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.17 
 
 		 526 aa  87.8  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.01 
 
 		 524 aa  87.4  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.45 
 
 		 508 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.28 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.4 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.87 
 
 		 523 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.19 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.39 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.86 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.52 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.89 
 
 		 536 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.8 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.8 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.38 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.17 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.94 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.24 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.96 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.14 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.59 
 
 		 563 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.88 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.32 
 
 		 532 aa  73.9  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.7 
 
 		 568 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  26.01 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.81 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.4 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  29.38 
 
 		 459 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  25.5 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.98 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  29.95 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.6 
 
 		 525 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.2 
 
 		 533 aa  62  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.42 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.45 
 
 		 528 aa  62  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  19.95 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  21.74 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  26.62 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  22.71 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  30.53 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.62 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.81 
 
 		 509 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  25.48 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.79 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  32.2 
 
 		 430 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  33.6 
 
 		 463 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1998  nitrogenase  25 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.95 
 
 		 355 aa  47.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  29.03 
 
 		 466 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.26 
 
 		 546 aa  43.5  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.990957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>