188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2702 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  100 
 
 
431 aa  879    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0281  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  39.95 
 
 
423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0757727  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  40.05 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  26.94 
 
 
466 aa  88.2  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2003  nitrogenase  26.51 
 
 
450 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.577427  normal  0.745673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  26.43 
 
 
460 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  24.86 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  22.71 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.39 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.73 
 
 
508 aa  76.6  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.82 
 
 
508 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  26.04 
 
 
463 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  23.99 
 
 
448 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  23.43 
 
 
450 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.56 
 
 
509 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.24 
 
 
568 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.88 
 
 
546 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.94 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.91 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1566  nitrogenase  23.89 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0772  nitrogenase  28.57 
 
 
451 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.96 
 
 
540 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  23.99 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.03 
 
 
530 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.37 
 
 
544 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.09 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.2 
 
 
541 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.07 
 
 
508 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  23.92 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.76 
 
 
563 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  22.56 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.23 
 
 
524 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28 
 
 
531 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  24.64 
 
 
488 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  24.28 
 
 
488 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.55 
 
 
533 aa  66.6  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  24.48 
 
 
501 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.07 
 
 
535 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.69 
 
 
508 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  24.28 
 
 
488 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.22 
 
 
507 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.75 
 
 
531 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.81 
 
 
526 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  21.96 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.98 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.36 
 
 
508 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  21.94 
 
 
482 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.3 
 
 
508 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  22.06 
 
 
458 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  27.17 
 
 
491 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  23.84 
 
 
731 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.37 
 
 
525 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.35 
 
 
506 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  23.28 
 
 
494 aa  63.5  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  26.42 
 
 
491 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  23.83 
 
 
480 aa  63.2  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  26.79 
 
 
491 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  24.91 
 
 
487 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  24.06 
 
 
483 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  22.92 
 
 
483 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.76 
 
 
530 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.74 
 
 
508 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.36 
 
 
508 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  22.11 
 
 
339 aa  62  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  27.5 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.37 
 
 
525 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  19.95 
 
 
488 aa  60.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  24.82 
 
 
488 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  21.46 
 
 
458 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.67 
 
 
534 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.67 
 
 
534 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  24.44 
 
 
482 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.81 
 
 
455 aa  60.1  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  24.35 
 
 
485 aa  59.7  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  23.95 
 
 
516 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25 
 
 
535 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  23.31 
 
 
483 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  21.95 
 
 
458 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23 
 
 
532 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2908  Nitrogenase  23.83 
 
 
502 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  20.92 
 
 
458 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.36 
 
 
523 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  22.08 
 
 
493 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.11 
 
 
535 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.07 
 
 
525 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.46 
 
 
541 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.48 
 
 
531 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.57 
 
 
517 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  23.68 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.45 
 
 
523 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2888  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.74 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  24.54 
 
 
515 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  23.83 
 
 
511 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  25.64 
 
 
746 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.41 
 
 
541 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.75 
 
 
535 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  25.6 
 
 
509 aa  52.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  20.7 
 
 
475 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2592  Nitrogenase  25 
 
 
511 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.17 
 
 
551 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>