187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1537 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.27 
 
 
525 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.29 
 
 
540 aa  648    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.02 
 
 
544 aa  725    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.77 
 
 
535 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 
563 aa  1156    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.62 
 
 
532 aa  645    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.27 
 
 
535 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.5 
 
 
535 aa  650    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  82.92 
 
 
568 aa  964    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.65 
 
 
533 aa  644    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37 
 
 
508 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.13 
 
 
508 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.81 
 
 
508 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.13 
 
 
508 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.71 
 
 
507 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.3 
 
 
508 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.93 
 
 
508 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.9 
 
 
508 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.45 
 
 
526 aa  321  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.99 
 
 
522 aa  317  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.55 
 
 
530 aa  316  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.07 
 
 
540 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.74 
 
 
530 aa  309  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.12 
 
 
546 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.2 
 
 
531 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.69 
 
 
534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.87 
 
 
534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.97 
 
 
531 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.03 
 
 
517 aa  303  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.87 
 
 
531 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.27 
 
 
535 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36 
 
 
532 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.32 
 
 
519 aa  300  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.75 
 
 
523 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.7 
 
 
525 aa  297  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.81 
 
 
523 aa  297  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.2 
 
 
541 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.98 
 
 
528 aa  294  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.59 
 
 
525 aa  292  9e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.11 
 
 
525 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.64 
 
 
526 aa  289  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.7 
 
 
506 aa  289  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.41 
 
 
524 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.26 
 
 
536 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.14 
 
 
541 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.45 
 
 
508 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.22 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.77 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  21.92 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  31.11 
 
 
491 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  26.24 
 
 
491 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  31.11 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  25.61 
 
 
493 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  30.45 
 
 
494 aa  75.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  31.36 
 
 
509 aa  75.1  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  23.84 
 
 
469 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  24.59 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  32.4 
 
 
487 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  31.41 
 
 
488 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  23.81 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  24.86 
 
 
493 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  23.89 
 
 
469 aa  71.2  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  30.92 
 
 
488 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  29.15 
 
 
482 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  28.37 
 
 
482 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  24.62 
 
 
483 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  24.04 
 
 
493 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  38.24 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  24.76 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.97 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  29.44 
 
 
485 aa  67.4  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  29.09 
 
 
483 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  40.2 
 
 
483 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  27.23 
 
 
480 aa  67  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  37.5 
 
 
488 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.38 
 
 
541 aa  65.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  22.99 
 
 
509 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.7 
 
 
463 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.98 
 
 
509 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  22.42 
 
 
460 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  22.11 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  23.72 
 
 
446 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  23.77 
 
 
469 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  21.15 
 
 
448 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  17.51 
 
 
425 aa  60.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1540  hypothetical protein  33.33 
 
 
406 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  21.39 
 
 
469 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0168  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  21.04 
 
 
533 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488812  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  23.87 
 
 
511 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  20 
 
 
505 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.95 
 
 
463 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.54 
 
 
467 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  22.6 
 
 
459 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  23.05 
 
 
452 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  23.55 
 
 
516 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  23.66 
 
 
490 aa  57  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  21.46 
 
 
461 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  22.61 
 
 
546 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1998  nitrogenase  24.59 
 
 
512 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  22.85 
 
 
456 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>