208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1874 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.74 
 
 		 530 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 		 525 aa  1095    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  79.1 
 
 		 531 aa  877    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.6 
 
 		 540 aa  678    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  72.27 
 
 		 541 aa  811    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.75 
 
 		 531 aa  653    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  75.47 
 
 		 524 aa  827    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  73.43 
 
 		 525 aa  804    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.72 
 
 		 546 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.63 
 
 		 532 aa  638    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.74 
 
 		 541 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.13 
 
 		 530 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.55 
 
 		 528 aa  634    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.71 
 
 		 535 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.63 
 
 		 531 aa  653    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.52 
 
 		 526 aa  702    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  72.87 
 
 		 523 aa  791    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  72.68 
 
 		 526 aa  797    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  98.67 
 
 		 525 aa  1082    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.49 
 
 		 536 aa  848    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  72.68 
 
 		 523 aa  786    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.36 
 
 		 522 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.19 
 
 		 517 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60 
 
 		 508 aa  632  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.59 
 
 		 534 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.59 
 
 		 534 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.76 
 
 		 519 aa  619  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.35 
 
 		 506 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.78 
 
 		 507 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.4 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.22 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.84 
 
 		 508 aa  315  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.53 
 
 		 508 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.27 
 
 		 508 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.27 
 
 		 508 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.95 
 
 		 533 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.78 
 
 		 532 aa  296  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.89 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.42 
 
 		 544 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.11 
 
 		 563 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.59 
 
 		 535 aa  291  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.06 
 
 		 568 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.98 
 
 		 535 aa  270  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.99 
 
 		 540 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.44 
 
 		 535 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.22 
 
 		 525 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.27 
 
 		 480 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  23.95 
 
 		 483 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  23.24 
 
 		 482 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  25.68 
 
 		 485 aa  94  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  25.4 
 
 		 483 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  25.05 
 
 		 488 aa  93.2  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  28.83 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  24.11 
 
 		 482 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  24.71 
 
 		 488 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  24.48 
 
 		 494 aa  90.5  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  24.47 
 
 		 488 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  21.8 
 
 		 402 aa  87  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  24.47 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  23.82 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  23.36 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  24.05 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  22.95 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  24.73 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.07 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  24.39 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  23.67 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  23.67 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  23.45 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  22.38 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  26.39 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  26.04 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  26.04 
 
 		 491 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.75 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  24.61 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  23.78 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  23.26 
 
 		 448 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  22.74 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.29 
 
 		 430 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  22.99 
 
 		 444 aa  67  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  22.49 
 
 		 493 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.06 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  19.91 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  21.21 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  25.35 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  22.22 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.38 
 
 		 513 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  23.85 
 
 		 348 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  26.37 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  22.54 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.84 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  24.85 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  26.15 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  21.93 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.41 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1431  nitrogenase component I, alpha chain  22.48 
 
 		 475 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  19.69 
 
 		 511 aa  60.1  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.22 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1517  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  19.88 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.302679  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.38 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>