280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1847 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.6 
 
 
522 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.63 
 
 
525 aa  655    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  80.68 
 
 
530 aa  850    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  67.67 
 
 
508 aa  718    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.79 
 
 
534 aa  714    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.74 
 
 
541 aa  643    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  63.87 
 
 
528 aa  689    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.59 
 
 
531 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  82.5 
 
 
531 aa  865    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  62.45 
 
 
524 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  67.15 
 
 
546 aa  727    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  71.27 
 
 
540 aa  769    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  81.94 
 
 
531 aa  871    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  69.5 
 
 
541 aa  739    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.07 
 
 
519 aa  676    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  69.06 
 
 
530 aa  758    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 
532 aa  1069    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  69.52 
 
 
535 aa  737    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.79 
 
 
534 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.13 
 
 
506 aa  777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  71.96 
 
 
517 aa  761    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  62.73 
 
 
526 aa  676    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.82 
 
 
525 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.04 
 
 
526 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.04 
 
 
525 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.75 
 
 
523 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.82 
 
 
536 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.38 
 
 
523 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.18 
 
 
544 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.98 
 
 
533 aa  326  8.000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.32 
 
 
507 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.46 
 
 
508 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.15 
 
 
508 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.33 
 
 
508 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.38 
 
 
508 aa  315  9e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.78 
 
 
508 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.18 
 
 
535 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.15 
 
 
508 aa  313  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.25 
 
 
532 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.78 
 
 
508 aa  312  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.9 
 
 
563 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.51 
 
 
535 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.56 
 
 
568 aa  307  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.35 
 
 
540 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.54 
 
 
535 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.24 
 
 
525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.37 
 
 
480 aa  179  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  29.51 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  30.61 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  28.81 
 
 
488 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  29.67 
 
 
488 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  28.57 
 
 
488 aa  107  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  28.83 
 
 
488 aa  107  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  28 
 
 
485 aa  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  26.74 
 
 
482 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  28.47 
 
 
509 aa  100  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  27.36 
 
 
483 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  27.71 
 
 
483 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  27.38 
 
 
480 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  26.32 
 
 
494 aa  96.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  27.57 
 
 
482 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  27.13 
 
 
491 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  26.61 
 
 
483 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  27.36 
 
 
491 aa  90.9  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  27.36 
 
 
491 aa  90.5  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  27.27 
 
 
348 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  27.72 
 
 
355 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  24.32 
 
 
472 aa  84.7  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  20.59 
 
 
425 aa  84  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  29.77 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  26.04 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  27.51 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  21.29 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  22.84 
 
 
458 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  22.84 
 
 
458 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  24.19 
 
 
462 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  25 
 
 
493 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.09 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  24.21 
 
 
459 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  23.39 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  26.94 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  23.59 
 
 
462 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  29.39 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  25.33 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  22.9 
 
 
460 aa  73.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  25.71 
 
 
493 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  22.59 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  20.64 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  24.18 
 
 
451 aa  70.9  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  20.1 
 
 
469 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.97 
 
 
512 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  27.03 
 
 
493 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  23.53 
 
 
490 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  24.8 
 
 
456 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  23.45 
 
 
461 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  26.44 
 
 
511 aa  68.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  25.23 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  21.67 
 
 
446 aa  67  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.21 
 
 
518 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.19 
 
 
455 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>