More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1614 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  100 
 
 
425 aa  867    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  25.05 
 
 
462 aa  131  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.42 
 
 
466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  24.13 
 
 
490 aa  123  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  26.03 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  24.51 
 
 
462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  25.81 
 
 
462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  22.74 
 
 
475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  23.68 
 
 
446 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  21.63 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  23.6 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  25.95 
 
 
402 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  22.57 
 
 
460 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  24.42 
 
 
466 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  24.55 
 
 
448 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  23.19 
 
 
456 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  24.09 
 
 
458 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  23.3 
 
 
450 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  22.81 
 
 
457 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  23.28 
 
 
462 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  23.56 
 
 
448 aa  100  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  23.54 
 
 
461 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  22.2 
 
 
459 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  23.73 
 
 
462 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  23.44 
 
 
458 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  22.08 
 
 
458 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02610  vanadium nitrogenase, alpha subunit, vnfD  27.08 
 
 
474 aa  97.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.15 
 
 
517 aa  97.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.97 
 
 
461 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  23.34 
 
 
458 aa  96.3  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1632  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.11 
 
 
453 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00463409  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  22.79 
 
 
462 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.23 
 
 
535 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4139  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.58 
 
 
936 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1013  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.79 
 
 
456 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3932  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.35 
 
 
480 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.844513  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  21.24 
 
 
489 aa  92.8  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  21.56 
 
 
450 aa  93.2  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  27.82 
 
 
919 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.18 
 
 
489 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  24.4 
 
 
462 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1756  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.96 
 
 
453 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00502819  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  22.74 
 
 
462 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.5 
 
 
509 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4051  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.07 
 
 
456 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.283872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4796  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.49 
 
 
462 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.933705  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  22.89 
 
 
472 aa  91.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  27.72 
 
 
919 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  26.35 
 
 
746 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4026  nitrogenase vanadium-iron protein, alpha chain  26.23 
 
 
587 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  20.96 
 
 
531 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1350  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.64 
 
 
455 aa  90.5  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1052  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.36 
 
 
452 aa  90.5  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  23.39 
 
 
452 aa  90.1  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0773  nitrogenase  27.19 
 
 
487 aa  90.1  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.17 
 
 
508 aa  90.1  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1394  nitrogenase iron-iron protein, alpha chain  24.88 
 
 
519 aa  90.1  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  24.11 
 
 
466 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.35 
 
 
531 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  22.98 
 
 
461 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22 
 
 
463 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  22.53 
 
 
538 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  21.29 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1565  nitrogenase  26.1 
 
 
491 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.016954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.19 
 
 
463 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3491  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  29.3 
 
 
919 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1954  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.09 
 
 
453 aa  87.4  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.396368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3206  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  21.84 
 
 
918 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  28.91 
 
 
915 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.62 
 
 
519 aa  86.7  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  25 
 
 
511 aa  86.3  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1153  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.35 
 
 
454 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0447596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  28.07 
 
 
917 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0680  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.86 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  24.81 
 
 
501 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2003  nitrogenase  21.41 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.577427  normal  0.745673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  21.46 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0772  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  27.41 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  20 
 
 
506 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0772  nitrogenase  26.25 
 
 
451 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.69 
 
 
522 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.82 
 
 
508 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  22.8 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.68 
 
 
526 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  20.19 
 
 
534 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.36 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  20.19 
 
 
534 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  20.84 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.77 
 
 
541 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.18 
 
 
487 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1533  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.95 
 
 
453 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.936667  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  22.03 
 
 
731 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  19.49 
 
 
528 aa  84  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2620  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  24.28 
 
 
474 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1235  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  22.91 
 
 
463 aa  83.2  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336463 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1517  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  22.91 
 
 
463 aa  83.2  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.302679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4251  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  21.96 
 
 
905 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  25.92 
 
 
518 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  27.72 
 
 
918 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1566  nitrogenase  22.78 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>