More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2003 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2003  nitrogenase  100 
 
 
450 aa  909    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.577427  normal  0.745673 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  65.58 
 
 
450 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  56 
 
 
448 aa  542  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  56.19 
 
 
452 aa  531  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  36.05 
 
 
460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  35.47 
 
 
463 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  34.16 
 
 
444 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  35.24 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0772  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  36.18 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  33.72 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1566  nitrogenase  31.92 
 
 
447 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2888  oxidoreductase/nitrogenase component 1  31.15 
 
 
415 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0772  nitrogenase  32.15 
 
 
451 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  28.8 
 
 
446 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.4 
 
 
466 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  25.24 
 
 
402 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.08 
 
 
509 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  23.5 
 
 
509 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.66 
 
 
467 aa  98.6  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  24.05 
 
 
461 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  23.57 
 
 
462 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  27.17 
 
 
430 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  25.56 
 
 
458 aa  96.3  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  24.78 
 
 
475 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.46 
 
 
448 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  23.15 
 
 
458 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  23.2 
 
 
458 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  22.47 
 
 
458 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  24.89 
 
 
475 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  28.06 
 
 
515 aa  89.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  22.58 
 
 
462 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  24.14 
 
 
448 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  26.51 
 
 
431 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  21.37 
 
 
462 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.2 
 
 
465 aa  87  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  26.78 
 
 
511 aa  86.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1028  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.66 
 
 
504 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.41 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.33 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.4 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.01 
 
 
463 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.6 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.22 
 
 
524 aa  83.2  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  29.96 
 
 
347 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02590  vanadium nitrogenase beta subunit, vnfK  23.01 
 
 
475 aa  81.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  27.59 
 
 
746 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.13 
 
 
489 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.51 
 
 
485 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1050  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.7 
 
 
477 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1431  nitrogenase component I, alpha chain  23.82 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02770  nitrogenase vanadium iron cofactor biosynthesis protein vnfE  27.74 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2592  Nitrogenase  26.1 
 
 
511 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  21.52 
 
 
462 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.31 
 
 
489 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  27.65 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  23.8 
 
 
490 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  22.76 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.52 
 
 
523 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.24 
 
 
460 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  22.13 
 
 
462 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  21.54 
 
 
462 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  22.63 
 
 
489 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.27 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.09 
 
 
541 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  22.32 
 
 
462 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1176  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.95 
 
 
479 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  25.37 
 
 
501 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  26.99 
 
 
919 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  26.34 
 
 
518 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3932  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  27.24 
 
 
480 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.844513  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.25 
 
 
518 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.08 
 
 
489 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1565  nitrogenase  26.44 
 
 
491 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.016954  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1013  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.07 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153138  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  20.78 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.01 
 
 
542 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.32 
 
 
520 aa  74.7  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  27.17 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2620  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  26.18 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0235  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.36 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.317419  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  27.4 
 
 
516 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.9 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  29.17 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  27.72 
 
 
476 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  27.36 
 
 
919 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0168  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.43 
 
 
533 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488812  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  22.46 
 
 
462 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4051  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.37 
 
 
456 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.283872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.57 
 
 
459 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0773  nitrogenase  26.8 
 
 
487 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  25 
 
 
511 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3917  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27 
 
 
480 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0970  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.52 
 
 
487 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659095  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1195  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.59 
 
 
461 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00211602  decreased coverage  0.000102786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1540  hypothetical protein  27.32 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3206  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  25.6 
 
 
918 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.74 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.09 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.78 
 
 
518 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1201  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.46 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75707  hitchhiker  0.00777378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>