233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0622 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.72 
 
 		 525 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.33 
 
 		 530 aa  739    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  69.76 
 
 		 531 aa  742    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.29 
 
 		 528 aa  704    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  69.6 
 
 		 531 aa  733    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.52 
 
 		 534 aa  704    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.96 
 
 		 541 aa  641    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.27 
 
 		 531 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.61 
 
 		 524 aa  644    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 		 546 aa  1091    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.2 
 
 		 541 aa  764    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.84 
 
 		 519 aa  682    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  68.68 
 
 		 530 aa  763    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  68.07 
 
 		 535 aa  753    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.93 
 
 		 540 aa  789    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  68.68 
 
 		 506 aa  696    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  65.75 
 
 		 508 aa  710    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.23 
 
 		 526 aa  685    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.53 
 
 		 525 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.52 
 
 		 534 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  67.58 
 
 		 532 aa  714    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  65.16 
 
 		 522 aa  710    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  68.13 
 
 		 517 aa  737    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.56 
 
 		 536 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.64 
 
 		 526 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.84 
 
 		 525 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.62 
 
 		 523 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.54 
 
 		 523 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.81 
 
 		 535 aa  326  6e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.52 
 
 		 568 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.75 
 
 		 533 aa  312  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.74 
 
 		 544 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.52 
 
 		 532 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.12 
 
 		 563 aa  309  9e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.06 
 
 		 535 aa  306  6e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.7 
 
 		 535 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.7 
 
 		 525 aa  299  9e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.26 
 
 		 508 aa  295  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.57 
 
 		 540 aa  292  9e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.92 
 
 		 507 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.08 
 
 		 508 aa  290  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.13 
 
 		 508 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.19 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.26 
 
 		 508 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.77 
 
 		 508 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.95 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.4 
 
 		 480 aa  153  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  25.58 
 
 		 485 aa  91.3  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  30.82 
 
 		 491 aa  90.5  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  26.1 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  30.5 
 
 		 491 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  30.5 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  25.93 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  26.94 
 
 		 488 aa  88.2  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  25.51 
 
 		 483 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  27.71 
 
 		 487 aa  87  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  24.71 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  23.32 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  25.81 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  24.65 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  26.17 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  24.34 
 
 		 462 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  25.53 
 
 		 488 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  25.23 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  24.34 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  26.64 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  23.84 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  24.83 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.45 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  19.86 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  26.09 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  28.88 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.25 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  26.6 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  22.39 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  21.97 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  22.88 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0551  nitrogenase component I, alpha chain  24.49 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.39708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  22.15 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.42 
 
 		 430 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  21.43 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  25.33 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.91 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  20.57 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  21.89 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  22.95 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  22.89 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  23.66 
 
 		 482 aa  62  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.41 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  23.82 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  23.71 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  23.12 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  22.97 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  23.9 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  25.68 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  26.24 
 
 		 511 aa  60.1  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2620  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  25.58 
 
 		 474 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  22.34 
 
 		 450 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1517  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  23.28 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.302679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1235  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  23.28 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>