185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_07941 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  77.47 
 
 
531 aa  882    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.96 
 
 
531 aa  647    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.93 
 
 
540 aa  679    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.68 
 
 
525 aa  872    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  77.16 
 
 
541 aa  860    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  77.24 
 
 
524 aa  846    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.79 
 
 
525 aa  790    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  59.56 
 
 
546 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  58.35 
 
 
528 aa  635    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.74 
 
 
531 aa  650    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.72 
 
 
541 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  62.06 
 
 
530 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  62.06 
 
 
535 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.63 
 
 
530 aa  648    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  63.81 
 
 
526 aa  686    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.63 
 
 
523 aa  790    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  69.48 
 
 
526 aa  778    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  76.68 
 
 
525 aa  872    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 
536 aa  1111    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.26 
 
 
523 aa  780    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.8 
 
 
517 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.15 
 
 
532 aa  629  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.86 
 
 
522 aa  631  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.75 
 
 
508 aa  624  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.04 
 
 
534 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.04 
 
 
534 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.35 
 
 
519 aa  609  1e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.3 
 
 
506 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.89 
 
 
507 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.55 
 
 
508 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.27 
 
 
508 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.38 
 
 
508 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.37 
 
 
508 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.74 
 
 
544 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.38 
 
 
508 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.02 
 
 
568 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.12 
 
 
533 aa  297  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.53 
 
 
563 aa  296  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.32 
 
 
532 aa  296  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.78 
 
 
508 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.04 
 
 
508 aa  290  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.64 
 
 
535 aa  288  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.51 
 
 
535 aa  276  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.62 
 
 
535 aa  268  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.91 
 
 
540 aa  265  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.66 
 
 
525 aa  264  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.44 
 
 
480 aa  163  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  25.85 
 
 
482 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  22.91 
 
 
482 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  23.89 
 
 
488 aa  86.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  23.66 
 
 
494 aa  87  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  27.24 
 
 
485 aa  86.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  24.54 
 
 
487 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  24.61 
 
 
483 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  24.3 
 
 
488 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  25.63 
 
 
483 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  25.06 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  23.43 
 
 
483 aa  80.9  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  23.83 
 
 
488 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  23.38 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  23.83 
 
 
488 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  24.84 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  24.93 
 
 
491 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  22.4 
 
 
477 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  24.54 
 
 
480 aa  71.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  24.64 
 
 
491 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  24.64 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  20.85 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  19.95 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  22.68 
 
 
505 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  23.23 
 
 
462 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  23.23 
 
 
462 aa  64.7  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  23.23 
 
 
462 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0538  nifE, nitrogenase molybdenum-cofactor synthesis protein  24.9 
 
 
487 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.510346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  29.73 
 
 
463 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  29.44 
 
 
430 aa  63.9  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2189  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.62 
 
 
943 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.235442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  23.15 
 
 
444 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  21.47 
 
 
509 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  20.81 
 
 
509 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  25.19 
 
 
511 aa  62  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01450  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25 
 
 
475 aa  62  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4933  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.19 
 
 
480 aa  61.6  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613224  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  21.53 
 
 
469 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1517  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  21.69 
 
 
463 aa  60.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.302679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1235  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  21.69 
 
 
463 aa  60.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  34.75 
 
 
493 aa  60.1  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  22.34 
 
 
490 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  26.57 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.05 
 
 
348 aa  58.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02770  nitrogenase vanadium iron cofactor biosynthesis protein vnfE  23.57 
 
 
469 aa  57.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687288  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  20.97 
 
 
466 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.93 
 
 
448 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  25.7 
 
 
482 aa  57  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  24.3 
 
 
451 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.63 
 
 
511 aa  56.6  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1249  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.93 
 
 
540 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0233  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein nifE  23.37 
 
 
560 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0640534  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3629  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.63 
 
 
482 aa  56.2  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.205847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3007  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  42.62 
 
 
69 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>