65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0124 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  74.03 
 
 
469 aa  736    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  72.96 
 
 
469 aa  725    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0124  chlorophyllide reductase subunit Z  100 
 
 
469 aa  965    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.957131  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  73.29 
 
 
469 aa  701    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1716  chlorophyllide reductase subunit Z  71.22 
 
 
468 aa  699    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  74.63 
 
 
468 aa  740    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  70.3 
 
 
469 aa  693    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  51.04 
 
 
493 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  50.62 
 
 
493 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  46.67 
 
 
493 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  39.37 
 
 
482 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  41 
 
 
480 aa  335  7e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  38.95 
 
 
483 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  39.5 
 
 
483 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  38.69 
 
 
485 aa  329  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  39.87 
 
 
482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  39.46 
 
 
483 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  37.32 
 
 
488 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  38.02 
 
 
494 aa  323  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  38.08 
 
 
509 aa  323  4e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  39.38 
 
 
487 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  38.18 
 
 
488 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  38.18 
 
 
488 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  37.11 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  36.49 
 
 
491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  36.49 
 
 
491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  37.83 
 
 
488 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  38.12 
 
 
488 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.89 
 
 
508 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.89 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.95 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.39 
 
 
508 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.25 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.41 
 
 
508 aa  77  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.09 
 
 
507 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.76 
 
 
508 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.04 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  22.19 
 
 
446 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.96 
 
 
544 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.9 
 
 
563 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.14 
 
 
532 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.47 
 
 
568 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.81 
 
 
526 aa  51.6  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.02 
 
 
533 aa  51.2  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.91 
 
 
526 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.31 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.85 
 
 
525 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.72 
 
 
541 aa  47.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  23.72 
 
 
339 aa  46.6  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  23.87 
 
 
463 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.15 
 
 
509 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  24.11 
 
 
516 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2888  oxidoreductase/nitrogenase component 1  24.94 
 
 
415 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.33 
 
 
534 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.52 
 
 
506 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.89 
 
 
525 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.33 
 
 
534 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  21.56 
 
 
515 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  20.73 
 
 
460 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24 
 
 
532 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  21.58 
 
 
509 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.72 
 
 
525 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25 
 
 
480 aa  43.5  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  20.53 
 
 
466 aa  43.5  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.45 
 
 
535 aa  43.5  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>