69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0177 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  100 
 
 		 468 aa  970    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  75.27 
 
 		 469 aa  743    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  72.49 
 
 		 469 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  72.07 
 
 		 469 aa  699    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1716  chlorophyllide reductase subunit Z  77.35 
 
 		 468 aa  761    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0124  chlorophyllide reductase subunit Z  74.63 
 
 		 469 aa  740    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.957131  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  76.34 
 
 		 469 aa  742    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  50.52 
 
 		 493 aa  481  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  49.27 
 
 		 493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  45.3 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  41.05 
 
 		 482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  41.89 
 
 		 483 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  41.47 
 
 		 483 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  40.93 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  40.94 
 
 		 480 aa  343  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  39.79 
 
 		 485 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  40.79 
 
 		 487 aa  339  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  39.46 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  38.83 
 
 		 483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  39.87 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  38.52 
 
 		 509 aa  333  3e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  39.04 
 
 		 491 aa  332  8e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  38.83 
 
 		 491 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  39.52 
 
 		 488 aa  326  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  39.74 
 
 		 488 aa  325  9e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  38.24 
 
 		 494 aa  324  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  38.95 
 
 		 488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  38.16 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.66 
 
 		 508 aa  78.2  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.06 
 
 		 508 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.62 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.21 
 
 		 508 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.28 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.81 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.46 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.64 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.93 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.63 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.86 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.31 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.7 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.57 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.86 
 
 		 522 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.43 
 
 		 531 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.49 
 
 		 506 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.41 
 
 		 517 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.67 
 
 		 534 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.26 
 
 		 531 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.67 
 
 		 534 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.04 
 
 		 525 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  22.1 
 
 		 509 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.56 
 
 		 530 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.66 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.31 
 
 		 536 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.59 
 
 		 541 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.64 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.08 
 
 		 508 aa  48.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.67 
 
 		 541 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.31 
 
 		 526 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.93 
 
 		 535 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.35 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0062  nitrogenase alpha chain  17.97 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  19.71 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.38 
 
 		 535 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  23.57 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  17.83 
 
 		 728 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1800  nitrogenase alpha chain  19.72 
 
 		 477 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.515019  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  20 
 
 		 463 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.31 
 
 		 546 aa  43.1  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>