80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0157 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  75.43 
 
 		 469 aa  758    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  75.27 
 
 		 468 aa  743    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0124  chlorophyllide reductase subunit Z  74.03 
 
 		 469 aa  736    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.957131  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  69.23 
 
 		 469 aa  686    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1716  chlorophyllide reductase subunit Z  69.96 
 
 		 468 aa  687    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  70.09 
 
 		 469 aa  697    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  100 
 
 		 469 aa  967    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  50.52 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  50.1 
 
 		 493 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  45.83 
 
 		 493 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  39.71 
 
 		 482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  39.25 
 
 		 483 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  39.25 
 
 		 483 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  38.36 
 
 		 482 aa  339  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  39.57 
 
 		 480 aa  338  9e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  37.11 
 
 		 488 aa  332  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  37.16 
 
 		 485 aa  329  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  38.27 
 
 		 491 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  36.4 
 
 		 483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  35.26 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  38.48 
 
 		 491 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  38.27 
 
 		 491 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  38.12 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  35.6 
 
 		 494 aa  320  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  36.9 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  36.52 
 
 		 488 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  36.74 
 
 		 488 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  36.18 
 
 		 488 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.48 
 
 		 508 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.09 
 
 		 508 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.26 
 
 		 508 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.87 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.05 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.5 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.4 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.42 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.53 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.77 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.79 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.58 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  28.19 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.77 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.08 
 
 		 568 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  21.56 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.16 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.61 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.61 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.06 
 
 		 530 aa  57  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.45 
 
 		 519 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  21.52 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  24.49 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.03 
 
 		 532 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  26.24 
 
 		 516 aa  53.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  22.77 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.28 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.78 
 
 		 540 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.81 
 
 		 535 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.07 
 
 		 534 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.07 
 
 		 534 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.43 
 
 		 541 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.59 
 
 		 526 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  19.72 
 
 		 731 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.82 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  24.91 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  21.61 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2908  Nitrogenase  24.15 
 
 		 502 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  23.51 
 
 		 511 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  21.91 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.73 
 
 		 530 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.35 
 
 		 489 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  20.91 
 
 		 448 aa  47  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.24 
 
 		 541 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  23.1 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  20.22 
 
 		 509 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.74 
 
 		 519 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  22.72 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.92 
 
 		 525 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.72 
 
 		 526 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1565  nitrogenase  23.58 
 
 		 491 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.016954  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25 
 
 		 524 aa  43.5  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.864438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>