32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1871 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1871  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0411663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1690  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  79.33 
 
 		 208 aa  350  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422709  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1581  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  70.75 
 
 		 215 aa  320  8e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1486  hypothetical protein  73.61 
 
 		 216 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.963821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0855  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  67.65 
 
 		 206 aa  300  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000345785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2754  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  61.84 
 
 		 208 aa  266  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0201  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  57.77 
 
 		 208 aa  256  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0216517  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0119  hypothetical protein  56.86 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1090  hypothetical protein  67.95 
 
 		 158 aa  231  9e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1421  hypothetical protein  59.86 
 
 		 148 aa  198  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.263177  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.74 
 
 		 535 aa  52.4  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.54 
 
 		 535 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  44 
 
 		 563 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.85 
 
 		 533 aa  48.5  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.48 
 
 		 525 aa  48.5  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40 
 
 		 568 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.68 
 
 		 480 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.96 
 
 		 508 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.96 
 
 		 508 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.33 
 
 		 535 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40 
 
 		 532 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.96 
 
 		 508 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.89 
 
 		 508 aa  45.1  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.28 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.77 
 
 		 540 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.85 
 
 		 507 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  41.51 
 
 		 508 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.69 
 
 		 544 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.08 
 
 		 532 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.96 
 
 		 508 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.89 
 
 		 546 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.78 
 
 		 519 aa  41.6  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>