15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0119 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0119  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2754  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  63.29 
 
 
208 aa  275  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1581  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  56.31 
 
 
215 aa  251  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1871  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  56.86 
 
 
216 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0411663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1690  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  54.95 
 
 
208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422709  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0855  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  51.94 
 
 
206 aa  228  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000345785  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1486  hypothetical protein  56.59 
 
 
216 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.963821  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0201  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  51.71 
 
 
208 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0216517  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1090  hypothetical protein  57.72 
 
 
158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1421  hypothetical protein  58.4 
 
 
148 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.263177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.33 
 
 
568 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.27 
 
 
508 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.81 
 
 
508 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.81 
 
 
508 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.77 
 
 
480 aa  41.6  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>