16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2754 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2754  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0119  hypothetical protein  63.29 
 
 		 206 aa  275  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1690  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  61.84 
 
 		 208 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422709  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1871  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  61.84 
 
 		 216 aa  266  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0411663  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0201  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  60.68 
 
 		 208 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0216517  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1581  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  60.1 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0855  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  56.1 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000345785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1486  hypothetical protein  58.94 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.963821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1090  hypothetical protein  60.54 
 
 		 158 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1421  hypothetical protein  52.82 
 
 		 148 aa  167  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.263177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.36 
 
 		 568 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.7 
 
 		 508 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4376  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  36.54 
 
 		 61 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4438  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  36.54 
 
 		 61 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0931404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0218  hypothetical protein  35.19 
 
 		 55 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  39.13 
 
 		 480 aa  41.2  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>