54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0218 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0218  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56 
 
 		 526 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  47.06 
 
 		 535 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  47.06 
 
 		 532 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3007  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  48 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  50 
 
 		 519 aa  52.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4376  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  47.06 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  45.1 
 
 		 525 aa  52  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4438  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  47.06 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0931404 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1289  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  46 
 
 		 546 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  48.98 
 
 		 534 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  50 
 
 		 522 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  49.02 
 
 		 531 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  48.98 
 
 		 534 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  51.02 
 
 		 530 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0245  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  41.18 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  42.31 
 
 		 541 aa  50.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  45.1 
 
 		 533 aa  50.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  45.1 
 
 		 535 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  51.02 
 
 		 531 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  46.94 
 
 		 540 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  44.9 
 
 		 528 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  51.02 
 
 		 531 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  48.98 
 
 		 532 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  47.06 
 
 		 540 aa  48.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  45.83 
 
 		 530 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1188  hypothetical protein  40.38 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.813947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  45.1 
 
 		 517 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  45.83 
 
 		 536 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  42.86 
 
 		 568 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.78 
 
 		 563 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  41.18 
 
 		 535 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  46.81 
 
 		 535 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  44 
 
 		 508 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  43.75 
 
 		 525 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  44 
 
 		 524 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.82 
 
 		 525 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  43.75 
 
 		 525 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  42.31 
 
 		 507 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.38 
 
 		 508 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.38 
 
 		 508 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.38 
 
 		 508 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  45.83 
 
 		 506 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  43.75 
 
 		 523 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  39.58 
 
 		 526 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  43.75 
 
 		 523 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2754  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  35.19 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  45.45 
 
 		 541 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.38 
 
 		 508 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.46 
 
 		 508 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.46 
 
 		 508 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.54 
 
 		 508 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38 
 
 		 544 aa  40.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>